新生儿肠炎是由多种病原体引起的，如细菌、病毒、真菌等。其中常见的有细菌和病毒。所以需要确定什么是病原体感染。
在治疗中，如果腹泻呕吐严重，可以短时间禁食8小时，然后开始喂养。母乳或稀释牛奶或腹泻奶粉为佳。补充液体，防止脱水，纠正脱水，这要看宝宝腹泻的程度。
抗生素用于感染，微生态调节剂益生菌用于补充肠道正常菌群。所以肠炎的治疗要看宝宝的情况。
一般情况下，肠炎结肠炎可以使用饮食调整以及口服药物的方式进行治疗。具体分析如下：
1.饮食调整：通常来讲，建议肠炎结肠炎患者可以适当吃葡萄、菠萝、橘子、菠菜等富含维生素的水果和蔬菜，加速炎症的消散，可以使症状得到缓解，少吃肉类食物。
2.口服药物：除饮食调整外，患者还可口服乳酸菌素片、多酶片等增加肠道有益菌的药物进行改善肠道功能。
直肠炎要去做一个肠镜，看一下肠道内壁情况，明确下具体的病因，对症下药。单纯的肠炎，要控制饮食，避免辛辣刺激冷硬食物，规律进餐，然后消炎治疗平时注意腹部保暖，避免受凉。要饮食有规律，一日三餐做到定时定量，不过分饥饿、不暴饮暴食，这样有利于肠道消化平衡，避免因无节制饮食而致肠道功能紊乱。
对于肠炎的孩子首先需要判断一下是细菌感染引起的还是病毒感染引起的，如果是细菌性的肠炎，需要使用抗生素控制感染的。如果是病毒性的肠炎，对症处理就可以了。可以口相应的药保护胃肠粘膜，适当的让宝宝多喝水以免出现脱水的情况。可以选择口服补液盐的，不管是什么原因引起的拉肚子都需要注意饮食卫生，尽可能吃一些容易消化的食物，并且采用少量多次的喂养方式。
小儿肠炎时可以要到医院接受专业医生的治疗，不要自己私自的用药，以免对身体造成伤害。平时的生活中要注意饮食卫生，因为饮食不卫生是小儿肠炎的重要因素，不要给宝宝吃生冷的食物，可以多吃一些温性的水果和蔬菜，多喝水。而且还要保持家居的卫生也是很重要的。