婴儿水样腹泻被认为是由消化不良或腹部感冒引起的。治疗消化不良的药物可用于治疗。此外，还要注意妈妈的饮食。选择易消化的食物，而不是生冷的食物。增加营养有助于调节婴儿的状况。多喝水。防止脱水。
宝宝拉水样大便，及时完善大便常规检查，确定大便内不含有白细胞，排除细菌感染性腹泻的诊断。如果是感染细菌，需在医生指导下服用抗生素，控制肠道内外感染，避免滥用抗生素。
腹泻时其大便性状发生改变，其中水样便较为常见，可由病毒或产毒性细菌感染导致。若婴儿腹泻呈水样便，常见轮状病毒、诺如病毒影响肠道黏膜对水分及电解质的吸收，肠液积聚，进而导致腹泻水样便。
去进行一下，便常规和血常规的检查，做血常规，大便常规检查以及血生化检查确定，确实存在感染及时治疗，及时就诊。明确诊断才能对症处理。这期间尽量让宝宝休息，暂停进食，口服补液。同时注意宝宝肛门周围的皮肤卫生。严密观察。
婴儿水样腹泻可能与消化不良有关。可以给宝宝的腹部敷热敷。应该注意保持腹部温暖，三顿饭要有规律的饮食。不应该吃小食品、油炸食品和膨化食品。也可以在医生的指导下给宝宝一些药物、乳酸菌片和其他治疗药物。应该保持室内空气新鲜，温度适当。
导致宝宝水样腹泻的原因有：生理性稀便，由于正常新生儿的肠道功能尚未健全，不同喂养方式的宝宝大便性状也存在明显区别；喂养不当，爸妈给新生宝宝喂食的奶粉过浓、奶粉不适合、奶粉中加糖、奶液过凉或过早添加米糊等淀粉类食物，都会容易导致宝宝积食，从而引起腹泻；病毒或细菌感染，新生儿免疫功能差尤其是肠道的免疫能力就更低，当肠道感染时，没有能力去减弱和中和细菌的毒力。