一般情况下，新生儿消化不良的原因可能是消化液分泌过少导致的，具体分析如下：
宝宝的肠道菌群没有得到很好的调节，消化液分泌不足，一日十次以上，出现大量的乳汁和哭泣。喂奶的时候可以将奶粉冲淡一些，数量可以适当的增加，少量的喂奶，同时要注意捏住奶嘴，防止发生吞咽引起的呛咳，如果宝宝的粪便数量比较多，可以用妈咪爱来调整肠道的菌群。
新生儿消化功能不健全，容易导致消化不良，主要表现为：
1、宝宝打嗝、晨起时口腔有异味；
2、婴儿的食欲显著降低，并伴有腹胀，肚子咕咕作响；
3、婴儿在溢乳后易怒、啼哭；
4、小儿大便频数增加，并伴有腹泻，大便有异味；
5、孩子睡觉困难，睡眠质量差，还会有发热症状。
6、腹胀、阵发性哭闹或烦躁、食欲不振、恶心、吐奶、便秘及腹胀腹泻、粪便中有奶瓣等。
新生儿的消化不良，如果大便里有奶瓣，一般是因为喝多了。因为婴幼儿的肠胃还没有完全发育，所以如果母乳喂养太多或间隔太短，会导致肠道内的营养物质没有被充分消化而被排泄出来。
牛奶是由未充分消化的蛋白质与食物中的矿物质结合而成。建议母亲随时注意宝宝排泄物的状况，如果在喂奶后仍有问题，应及时到医院检查，看看有没有肠胃方面的问题。
婴儿消化不良首先表现就是吐奶，能吃辅食的时候。出现呕吐、腹胀、腹泻。肚子就是特别涨，哭闹不安，还有就是腹泻，比如有的就是像解稀大便，一天两到三次，还有的就是稀水便，一天两到三次。
孩子的消化能力和孩子对营养的需求量不成正比，往往会导致消化不良症，建议服用相关的药物，适用于因肠道菌群失调引起的胀气、消化不良等，首先让孩子的饮食有规律并且符合体质。确保每顿饭适量不至于太多，确保食物不会含太多脂肪太过于油腻。
宝宝打嗝或者晨起时口腔发臭，宝宝食欲明显下降，且伴有腹胀、小肚子咕噜叫的情况，宝宝溢奶后烦躁不安，并出现哭闹现象，宝宝排便次数增多，伴有腹泻症状，且排泄物酸臭，宝宝入睡困难，睡眠质量不好，同时可能会出现发烧的情况。