新生儿注射疫苗化脓，是因为接种了卡介苗，是正常的反应，不用做任何处理，不要让化脓的地方沾水即可。
接种卡介苗两周左右会有局部红肿浸润、化脓、小溃疡。严重的要适当治疗，接种过程中可能有接种卡介苗后局部脓疱或溃烂的反应，不必擦药或包扎，保持局部清洁，衣服不要太紧。有脓液流出用无菌纱布或棉花擦净即可，不要用手去挤，约两三个月会愈合结痂，痂皮要自然脱落，不能用手抠去。
宝宝自身抵抗力比较差，皮粘膜比较弱，因此若接种部位处理不规范，很可能会出现感染甚至化脓。宝宝打预防针后若化脓，局部要保持清洁，衣服不要穿得太紧，避免局部摩擦。如有脓液流出，不要挤压，可用无菌纱布或棉花拭净，也可以使用碘伏局部消毒。
如果是接种卡介苗的局部化脓是正常现象，因为接种完卡介苗后会有一个局部红肿，破溃，化脓的过程，不需要特殊处理，有脓液时可以用干净的棉签将经脓液清理干净就可以。
通常来说，新生儿打预防针的地方化脓了可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
1.一般治疗：如果症状比较轻微，患者应该注意一般治疗，即注意清理局部，用干净的棉签将经脓液清理干净，避免让新生儿的皮肤沾水，有助于缓解症状。
2.使用药物：如果症状较重，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有阿莫西林胶囊。
新生儿黄疸要具体分析，要找到导致黄疸的原因，通常有生理性的和病理性的。
生理性黄疸通常没有关系，黄疸程度不重可以打预防针。若是病理性的黄疸，如婴儿有肝炎综合征，或感染导致的黄疸，或有胆道闭锁导致的黄疸，通常是比较严重的，要住院治疗。此时打预防针会对身体造成损害。婴儿黄疸要找医生诊治，排除疾病因素导致的黄疸，排除后是可以打预防针的。
新生儿在接种疫苗之后，可能会出现发热和情绪烦躁的反应，这都是正常的。在接种疫苗之后，一般会先观察半个小时。如果有明显的不适反应，需要及时的就医，选择积极的处理方法。
在给新生儿接种疫苗之前，和接种疫苗之后的半个小时，都不能够喂奶和喝水。给新生儿接种的疫苗，一般是卡介苗和乙肝疫苗。在接种疫苗的时候，需要到专门的卫生站或者是儿童医院。