三个月的宝宝，每次服用三分之一袋，一天三次，益生菌冲剂主要作用是抑制肠道的病菌生长繁殖补充肠道的消化酶，促进吸收消化。也可以增强免疫力，预防阴道感染缓解过敏的作用。
合生元益生菌的婴儿用量为零到十二个月的宝宝，每天一包，早晚各半包。12个月以上的宝宝每天两包，早晚各一包，早餐前或同餐服用效果更好，冲服时水温在37度以下，可用温水或直接加入牛奶、米糊等流质食品中，调匀饮用。
用量要看是两周岁以上，还是两周岁以下，如果两周岁以下的情况下，一次喝一袋就可以了，如果两周岁以上，就建议每次一到两袋就可以了，冲剂是颗粒状的，只要冲到温水里给宝宝服用就好了，对于这个月龄的宝宝，一天早晚各半包就好了。
在婴儿出现消化吸收不良的时候，可以服用，一般一天一包，一天两次，每次服用半包的量。平时要注意给宝宝补充营养，保持营养结构均衡，及时的补充微量元素和维生素。给宝宝多喝水，避免引起消化不良。
三个月宝宝吃益生菌可以在三个月宝宝配方奶粉中添加一些益生菌，让其充分溶解后再喂食。父母还可以将其放入温水中，水温不宜高于40℃，因为这是一种活性微生物，一旦遇到温度升高，就会失效。给三个月宝宝喂食后20-30分钟能有效发挥药效，可以起到一定的作用，可以帮助宝宝增强消化能力，减轻身体的不适。父母给宝宝喂奶粉的时候注意少量多次。
合生元益生菌婴儿用量是每天两次，每次吃一袋，对于那些年龄比较小的宝宝来说，用法却有很大的不同。在六个月以下的宝宝使用的量应该是每天半包，那些六个月以上一岁以下的宝宝，每天使用一包。对于那些一岁到七岁以下的宝宝来说，使用量为正常的每天两包。