三个月宝宝消化不良可以采取药物治疗和物理治疗。
家长可以给三个月宝宝应用山楂或者麦芽给孩子熬水喝，从而可以起到消食、助消化的作用。其次是给三个月宝宝按摩，可以按揉儿中脘穴，中脘穴位于肚脐眼向上4寸的部位。可以用中指点揉中脘穴，从而起到良好的助消化作用。此外是给三个月宝宝服用消食化积的中成药，比如小儿消积止咳口服液。
宝宝出现消化不良的症状，会出现恶心、呕吐、腹胀、食欲不振。具体内容如下：
如果有这个症状，可以进行按摩，通过顺时针方向的推拿，可以促进肠胃的运动，有助于消化。同时要注意保护孩子的身体，避免感冒，可以多喝粥、蛋黄粥、蔬菜粥等，避免食用辛辣刺激的水果，避免引起肠胃不适。避免食用过热食物，过热类的食物会刺激溃疡面，导致疼痛感加剧，严重情况下使得溃疡面发生血管扩张，引发出血。避免食用辛辣类食物，该类食物会刺激溃疡面，增加胃酸分泌。
宝宝消化不良可以通过改善生活方式、调整饮食结构、药物治疗等方式来调理。
首先，可以多做游戏和有氧运动，促进肠胃蠕动和消化，改善消化不良。建议每天保持一定的运动量，促进身体发育，促进肠道消化，养成良好的排便习惯。其次，消化不良可能与进食过多、消化不良有关，建议减少进食量，少食多餐，定时定量进食，避免食用辛辣油腻的食物。日常生活中多吃富含维生素、纤维素的水果、蔬菜，如苹果、香蕉、芹菜等，纤维素能促进肠道蠕动，促进肠道的消化。如果长期消化不良，可以口服乳酸菌素片、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、胰酶肠溶胶囊、神曲消食口服液等药物治疗。儿推拿、中药敷贴、推拿、按摩等也可调理脾胃功能。
三个月的宝宝出现消化不良的情况，可以通过以下方法缓解：
1、按摩腹部。可以顺时针按揉上腹部，使其具有一定的穿透性，有利于肠道的蠕动影响。可以通过滴眼液。
2、服用药物。可以通过口服干草二联杆菌等的益生菌来调理肠道菌群，帮助消化吸收食物。
3、更换奶粉。婴幼儿使用的奶粉中含有大量的油脂，很有可能会导致消化不良，可以通过更换配方来缓。
宝宝经常出现消化不良的问题，多是因为脾虚所致，脾不好，就会影响胃的消化功能，长期堆积后，就会导致宝宝消化不良的情况出现，可以通过健脾药物、推拿按摩来改善。
一、健脾药物
健脾药物可以选择丁桂薏芽健脾凝胶。它的成分安全，有山药、大枣、薏米、山楂等药食同源的成分，不仅能够帮助宝宝开胃消胀，还能从根源健脾，改善经常消化不良的问题，并且口味是酸甜果泥味，宝宝在消化不好的情况下更易接受。
二、推拿按摩
日常要做到宝宝的保暖工作，避免腹部着凉，可以适当的对宝宝进行推拿按摩，可以沿着宝宝的脊柱两侧，从腰部往上捏，直到颈部结束，要让宝宝感到舒适，不能过于用力，这种方法可以改善宝宝消化不良的问题。
通常情况下，消化不良胀气的患者可以通过使用药物、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：消化不良胀气的患者可以按照医嘱使用复方消化酶片、健胃消食片、枸橼酸莫沙必利胶囊等药物进行治疗。
日常护理：消化不良胀气的患者可以用热水袋进行局部热敷，或者进行腹部顺时针按摩，多喝热水，做好腹部的保暖工作，有助于加速气体排放