宝宝吃母乳腹泻可以遵医嘱使用药物进行治疗。
宝宝吃了母乳会拉肚子，这属于一种生理的拉肚子，因为母乳属于流食，宝宝的消化能力强，所以宝宝会有拉肚子的症状。也可能是因为对母乳的敏感引起的，可以口服一些可以调节消化道的药物，例如枯草杆菌二联活菌颗粒，但千万别乱吃，以免加重宝宝的胃肠负担。同时需要停止哺乳，可以选择用牛奶替代母乳喂养。
考虑孩子年龄太小，胃肠功能发育不完全，容易有消化不良的情况。可以给孩子口服补充一下肠道益生菌，如果一段时间后仍没有改善，就需要尽快带着孩子到当地正规医院儿科就医检查并治疗了。
宝宝吃母乳腹泻，母亲的饮食要以清淡的食物为主，尽量少食用油腻食物，其次孩子可以尝试着使用脐贴来缓解一些症状。如果是情况比较严重的，可以去医院儿科进行就诊，遵医嘱进行治疗。
宝宝吃母乳拉肚子时，应该及时就医，在医生的指导下，进行对症治疗。以母乳为主要诱因的小儿的腹泻，临床上叫做母乳性腹泻，一般多发生在六个月以内，纯母乳喂养的宝宝身体上。一般母乳性腹泻的宝宝无需治疗，就是继续哺乳就可以了，随着宝宝成长，添加辅食自然就会好转。但是如果宝宝有发热呕吐、小便减少、或者体重增长不佳，就要及时就医了。
吃母乳婴儿腹泻大便，如果宝宝没有哭闹等不适，精神状态好，胃口好，身高和体重增长都很正常，这是正常的，不需要特别的处理，等过了一个月，这种情况就会逐渐消失。
如果宝宝食欲不佳，出现脱水症状，可以通过口服肠道益生菌来调节肠道菌群的平衡。比如双歧三联活菌散、乳酸菌素片等。在孩子拉肚子的时候，妈妈要避免吃生冷辛辣的食物。如果孩子的腹泻症状减轻了，可以适当的调节一下自己的饮食。
一般比较轻的生理性腹泻无需治疗，妈妈可以继续哺乳。这样宝宝机体会逐渐适应母乳中的合适药物，乳糖酶亦会逐渐发育成熟，酶的活性增加，逐步能够分解、消化和吸收乳糖，并随着增加辅食逐渐好转。在饮食方面，可以喂鲜豆浆加合适药物代乳，对于生理性的腹泻即可得到控制。豆浆喂养不宜长期单独应用，宜逐步加鱼蛋白。具体方法是用米汤冲调鱼蛋白宝宝每日喂哺3顿就可以了。