矮小症临床上常可看到，治疗时应该以家长身高来推算出期望的最终高度。同时应结合患儿预期全面制定治疗目标，根据不同病因，治疗时机有所不同。
如果体内的生长激素缺乏，大概要2年或者2年以上。若为性早熟，也要1年半、2年以上。
如果发现孩子身高生长异常，建议及时带孩子就医检查，查明病因后采取治疗。一般建议给孩子保证充足的营养，带动孩子运动，促进发育。
青春期矮小症的治疗主要有以下几种：
1.药物治疗：治疗特发性矮小、青春期延迟、生长激素不足导致的矮小。
2.改变生活方式：在进行生长激素治疗的基础上，要注意纠正孩子的偏食等不良行为，注意营养均衡，及时补充营养，保证充足的睡眠，有利于孩子的身高发育，多做运动。
建议患者到儿科就诊，进行完善的检查，并确定具体的治疗方案。
矮小症的治疗方面首先判断病因，包括内分泌的因素、非内分泌的因素。内分泌的因素常见的包括生长激素的缺乏，与垂体有关，也与颅内的一些病变有关。如果颅内有一些器质性的病变，可以针对器质性病变进行治疗，之后如果需要进行生长激素的替代治疗，就给予生长激素的替代。
对矮小症患儿大多因生长激素不足所致，需皮下注射生长激素，治疗时患儿年龄愈小愈有效，在治疗同时，提出了高效补锌、硒和其各种微量元素。
另外在饮食方面可以增加蔬菜和水果的摄入，适当控制蛋白质摄入量，避免高脂肪高蛋白食物。改善孩子饮食习惯，孩子运动量少，需加强锻炼，转变生活习惯，有必要改变孩子睡觉晚的毛病。
矮小症可通过应用生长素、积极锻炼、进行心理调节等进行治疗。
由于长期腹泻或营养不良所致的矮小症，需通过改变饮食来增强患者身体营养，并通过治疗腹泻来缓解矮小症。生长激素缺乏症患者可采用生长激素针治疗，普通矮小症需要1-2年左右才能达到理想的治疗效果。可根据自身情况选择生长激素注射剂量。孩子出现矮小症后，不仅要补充营养，还要注意锻炼，要加强运动，尤其是弹跳运动，并保证孩子充足的睡眠。同时孩子身材矮小会导致自卑、抑郁等，家长可通过心理辅导，与孩子进行沟通，如培养兴趣爱好，增强自信，逐渐改善孩子抑郁等心理问题。
婴幼儿矮小症通常可以通过日常护理、使用药物等方法来治疗。
在出现婴幼儿矮小症的情况后，通常需要针对儿童矮小的原因，采用个体化的治疗方案。矮小症是由于各种原因引起的，需要及时发现原因，根据病因进行治疗，适当给予营养、运动和心理治疗。此外，基因重组人生长激素是目前常用的激素替代疗法。一些患者经过全面的治疗后，可以达到正常的身高。