做微创手术，先把巧克力囊肿给弄掉，然后再按照正常情况去备孕，如果是备孕半年都失败，可以考虑试管婴儿。巧克力囊肿通常来说也就是和内膜异位症有很大的关联，内膜异位症会影响到怀孕的。
避免食用过多油腻的食物，因为脂肪会形成堆积，使伤口不能快速愈合，对细菌的抵抗能力也是会减弱的，所以不要食用太多。不要食用容易胀气的食物，高淀粉类的食物：萝卜、土豆、红薯、芋头、南瓜、板栗等。
生殖中心做个评估，如果囊肿不大，输卵管通畅有问题，可以直接做试管婴儿。囊肿较大可以考虑穿刺抽取囊液，用GnRHa控制3-6个月后做试管婴儿;或者取卵后再次腹腔镜手术，术后再进行胚胎移植。
根据个人体质不同，时间自然也不一样。巧克力囊肿术后一般一个月就可以恢复。恢复的时间长短，和手术后的保养也有很大关系，所以术后要多休息，在恢复期间，定期到医院复查看恢复情况。
如果巧克力囊肿小于4cm，痛经情况较轻，也没有不孕的病史，可以考虑先不手术，直接试孕。试孕过程中要定期复查B超，还有血CA125水平。一旦怀孕成功，孕期体内孕激素明显升高，可以抑制异位内膜生长，使其萎缩。所以，孕期的巧克力囊肿基本不会生长，甚至到后期会缩小。
大多数情况下是术后半个月左右可以怀孕，但是具体还是要视身体的恢复情况而定。专家表示，巧克力囊肿术后试孕越早怀孕机会越大。因为巧克力囊肿的复发机会较高，并且随着时间的推移，妊娠的能力会逐渐下降，而术后是最容易怀孕的时期，妊娠的过程是对这个病的治疗，也许生完小孩后，此病就痊愈了。
