对于良性的右侧卵巢囊肿包块，进行卵巢囊肿切除术，尤其是对于年轻，在治疗时尽可能保留正常的卵巢组织。对于患有恶性卵巢囊肿包块的，时候病情已经比较严重甚至到了完全，治疗时要尽一切可能切除原发囊肿，对于盆腔、腹腔等病症转移处也需要全面切除，因此会采取子宫、肿瘤两天盆腹整块切除，这是最保险起见的方法。
右侧卵巢囊肿的治疗主要是：对于散在的比较小的右侧卵巢囊肿不需治疗，只要每年检查即可。对于密集的较小的纳氏囊肿或比较大的囊肿，可进行光疗、激光、微波、自凝刀等物理治疗、对于较大的突出于宫颈表面的，可考虑电刀切除治疗。
通常来说，宫颈纳氏囊肿和右侧卵巢囊肿可以通过手术进行治疗。
宫颈纳氏囊肿同宫颈柱状上皮异位、宫颈息肉一样，是慢性宫颈炎常见的一种表现，可以通过腹腔镜下卵巢囊肿摘除术；右侧卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，一般不会对人体造成损害，大多数患者的可自行消失，但部分患者的囊肿可不断增大，引起下腹部不适、月经异常等，可以通过手术进行治疗，比如卵巢囊肿剔除术、单孔腹腔镜下卵巢囊肿剥除术、卵巢切除术等。
可以保守治疗或者手术治疗，需要看肿瘤的大小而定。如果右侧卵巢囊肿在四公分以下，由于囊肿比较小没有办法手术治疗，采用保守疗法，可以服用药物治疗缓解症状。如果右侧卵巢囊肿在四公分以上，就需要进行腹腔镜下的卵巢囊肿剥除手术。
卵巢囊肿是妇科常见的肿瘤，可发生于任何年龄，其发病多有家族史，还与高胆固醇饮食，内分泌因素有关，此为卵巢肿瘤发病的高危因素，可以输液治疗或必要时手术治疗，并建议定期彩超复查。
可以考虑定期复查，手术切除等多种治疗方法，主要根据囊肿的大小及严重程度来决定，子宫右侧卵巢囊肿是育龄期妇女常见的一种妇科疾病，基本无症状性的卵巢囊肿可以不必治疗。