卵巢囊肿手术一般不影响生育，一般医生会考虑行卵巢肿瘤剥除术时，尽可能保留部分卵巢组织，以维持月经及生育功能。若不能保住卵巢，对以后的生育产生影响，医生会通知的。
单侧的、单纯的卵巢囊肿不会影响到生育。现在年龄小，囊肿比较小，如果有生育要求，可尽快怀孕，这样囊肿会自己吸收，也就不治自愈了。若无生育要求，建议中医保守治疗。因此病为代谢性质的疾病，即使手术，复发几率也是非常大的。
右侧卵巢囊肿对于正常的生育是有一定的影响的。不要太紧张，囊肿小于5厘米时，可先观察一般是通过药物治疗，定期复查。一般生理性的囊肿会消失，如果囊肿变大需要进行专业的检查治疗的。治疗期间注意卫生，注意休息，不要吃刺激性食物。
有可能影响生育。卵巢囊肿直径较小并且没有明显不适时不能排除是生理性的卵巢囊肿，可以暂时保守治疗观察的。可以在医生的指导下口服一些药物治疗，在月经干净后彩超复查，如果囊肿生长过快，有明显不适时需要手术切除。
左侧卵巢囊肿是否会影响生育，需要根据囊肿是否会影响卵巢排卵决定。
如果是单纯性卵巢囊肿不超过5cm，那么在来例假后就会自行消退，不会对排卵造成任何的影响。卵巢巧克力囊肿、囊肿比较大，没有正常的卵巢组织，会影响到卵巢的排卵，从而影响到生育。另外，卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症，会引起输卵管粘连、盆腔粘连，从而影响输卵管输送精子和卵子，从而引起不孕或宫外孕。
