巧克力囊肿诊断做，妇检、超声诊断、MRI、CT、腹腔镜及实验室检查等。应该到正规的专业医院仔细检查，查明病因，再对症治疗。平时要尽量吃清淡一点，要忌生冷刺激性的食物，注意个人的卫生也很重要。
B超是可以看到的。巧克力囊肿生长到一定阶段，就会引起输卵管粘连、堵塞，破坏输卵管的正常生理功能，从而导致继发不孕症。当多吃一些优质蛋白质、B族维生素、叶酸、铁、钙等营养物质，如鸡蛋、猪肝、牛奶、豆类及其制品、新鲜蔬菜、蘑菇、木耳、海带、紫菜、鱼类等。
B超发现卵巢囊肿，明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的。b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
需要做B超检查，腹腔镜检查，MRI检查，CA(卵巢癌相关抗原)值测定等检查，做阴道超声的时候也会发现盆腔里面卵巢上有囊肿，但是这种卵巢的囊肿往往跟生理性的囊肿不一样，有血供、有不均质的回声。
巧克力囊肿，又称卵巢内膜异位囊肿。是因子宫内膜漂洋过海，移民到卵巢内引发的一种疾病，是子宫内膜异位症中最常见的一类，与肿瘤性质的卵巢囊肿有本质的区别。子宫内膜“移民”到卵巢内后，仍受卵巢性激素的周期性影响。可以去正规专业的医院治疗，积极配合医生，一定会好起来的。
B超发现卵巢囊肿，一定要医生当时明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的，b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。因为子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。