卵巢的巧克力囊肿又叫做卵巢子宫内膜异位囊肿这是一种子宫内膜异位到卵巢上，引起的卵巢囊肿，一般的临床表现就是痛经，而且囊肿也会随着月经来潮缓慢增大。可以根据囊肿的大小决定是否手术，一般囊肿较大是需要手术治疗的。
巧克力囊肿癌变的症状是下腹不适感，为病人未触及下腹肿块前的最初症状。由于肿瘤本身的重量以及受肠蠕动及体位变动的影响，使肿瘤在盆腔内移动牵扯其蒂及骨盆漏斗韧带，以致病人有下腹或骼窝部充胀、下坠感。
巧克力囊肿又叫卵巢子宫内膜异位症，应该生长，在宫腔的子宫内，膜异位到卵巢上，而形成的异位囊肿。临床的主要表现为痛经，同房疼痛，继发性不孕，这些疼痛的表现主要表现为进行性的加重，如果异位囊肿比较大，出现破裂，那么有可能会出现急性腹痛等急腹症的情况。
卵巢巧克力囊肿的常见症状，性生活痛、这是卵巢巧克力囊肿最明显的症状，子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症等均可发生性生活痛，而且常于月经前较为明显；白带异常；痛经；即使没有避孕也不会出现怀孕的情况。
克力囊肿引起管腔闭塞、囊肿或粘连，均会妨碍精子、卵子或受精卵的运行，致使受精卵到达宫腔产生障碍而发生宫外孕。宫外孕时引起的输卵管破裂大出血，可危及生命。巧克力囊肿生长到一定阶段，就会引起输卵管粘连、堵塞，破坏输卵管的正常生理功能，从而导致继发不孕症。适当多吃一些优质蛋白质、B族维生素、叶酸、铁、钙等营养物质，如鸡蛋、猪肝、牛奶、豆类及其制品、新鲜蔬菜、蘑菇、木耳、海带、紫菜、鱼类等。
巧克力囊肿的早期症状是痛经，且呈进行性加重，有的也可没有症状，是由于不孕症，去医院检查时才发现的。巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血。