不能，巧克力囊肿一定要及时治疗，如果能放任其继续生长，会有一个破裂或者癌变的风险以免错过较好的治疗时机。同时应该保持一个比较良好的作息习惯和饮食规律。不要想着会自行痊愈。
巧克力囊肿是不能自愈的，所以得了巧克力囊肿一定要尽快的去当地正规的三甲医院进行医治，一般是通过手术和药物医治的，平时一定要注意饮食清淡，不要吃过于清淡的食物，平时要注意好的睡眠。
巧克力囊肿自愈的性不大，除非绝经月经不来了，卵巢巧克力囊肿是可以慢慢自行吸收，自行消退。巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢而形成的，这个病的特点就是痛经，并且呈逐渐加重的趋势。
正常卵巢囊肿不治疗，自己好的可能性很小，特别是年轻女性激素活动频繁，更降低囊肿的自愈几率。如果不治疗可能会变大，卵巢囊肿万一变大，就可能使下腹或背部隐隐作痛或感到肿胀。
初期巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现。巧克力囊肿在不采取任何治疗措施的情况下可能不会自行恢复。有一种极为特殊的情况，即怀孕后，在孕期月经不会来潮，这些异位的子宫内膜就不会出血，也不会生长，则有可能慢慢萎缩，从而使得巧克力囊肿自行恢复。而除此之外，巧克力囊肿可能不会自愈。