珠菌是单细胞真菌，在健康人皮肤、黏膜和阴道等部位均有存在。在一定条件下，念珠菌可侵犯人体组织引起炎症，其在女性生殖道的感染常常侵犯阴道。可能由于免疫力下降感染所引起，也有可能是大量服用抗生素导致身体免疫力下降所引起，还有可能就是泳池传染。
不注意个人卫生，没有勤换洗内裤，或者内裤并没有在阳光下暴晒，这样就会导致念珠菌的滋生。在公共场所接触到感染了念珠菌的坐便器，毛巾等，也会导致念珠菌性阴道炎出现。
原因有每周冲洗内阴三次以上，包括各种药物冲洗和非药物冲洗，夫妻生活男性没有彻底清洗，并且男性外生殖器中含有大量包皮垢，过分喜爱甜食，血糖较正常人高，长期服用类雌性激素或避孕药。
主要病因为阴道菌群失调。也可见于性接触传播，被污染的衣物用具，消毒不合格的卫生巾、卫生纸、护垫。也可能是内裤不洁引发。穿紧身内裤，内裤又非纯棉质地，导致外阴部潮湿又不透气，易导致炎症。
自身感染：用卫生巾导致阴道温度、酸碱度改变，引起正常真菌滋生导致自身感染，造成霉菌性阴道炎；患有免疫性疾病、糖尿病、脚气等疾病的女性，在免疫力下降时易发生感染。如夏天环境炎热、潮湿，容易滋生真菌，患有脚气的女性易感染霉菌性阴道炎。
霉菌性阴道炎主要致病菌是白色念珠菌，常伴随免疫功能低下，大量适用抗生素、皮质类固醇激素、免疫抑制剂等。或者是由霉菌又称真菌感染引起的，但一旦阴道的内环境受到破坏，乳酸杆菌明显减少，真菌大量繁殖就会引起明显的临床症状。