妇科。卵巢囊肿的病变部位长在不同的位置，要注意的是应及时去医院治疗，特别是卵巢囊肿长大了后如果需要切除卵巢，对身体影响较大，如囊肿的直径小于5厘米，又不是肿瘤，那一般是功能性的囊肿的可能性比较大。
巧克力囊肿应该看妇科内分泌科，如果是专科医院，考虑挂女性不孕科。它检查的时间是在月经完全干净7天之内。不要耽误，要及早治好才有效的正规医院妇科就诊，进行进一步检查，同时根据检查结果，确定手术的日期。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症而来的卵巢囊肿，是妇科病，需要挂妇科号就诊的。巧克力囊肿如果超过五厘米以上，是需要考虑手术的，可以在月经干净后去医院B超检查，了解囊肿的大小，结合月经，有无怀孕打算来决定治方法，如果是手术，可以考虑腹腔镜手术。
巧克力囊肿的主要临床表现是痛经，是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆，常进行性加重。不孕以及月经失调。性交疼痛，这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血，卵巢巧克力囊肿的症状并不是十分的明显。应该挂妇科。
巧克力囊肿属于子宫内膜卵巢异位症的一种，所以属于妇科的诊疗范畴，卵巢囊肿的病变部位长在不同的位置，要注意的是应及时去医院治疗，特别是卵巢囊肿长大了后如果需要切除卵巢。