可以，巧克力囊肿是由于有炎症的长期刺激和子宫内膜异位生长引起的。会随生理期周期性的脱落出血疼痛。主要临床表现就是引起月经量多，不规则出血，痛经等。有生育要求的可以保守治疗。症状严重者可以手术，囊液抽吸，性激素治疗等。
卵巢巧克力囊肿治疗后不会影响生育。手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是最符合本病处理方法。平时注意休息，以清淡易消化饮食为主，避免辛辣刺激性食物。
卵巢巧克力囊肿，属于子宫内膜异位囊肿，这类疾病可以导致不孕的发生，所以若是能怀孕，需要尽快怀孕等没有生育要求以后再考虑手术治疗，因为这类疾病很容易复发。
巧克力囊肿，会降低怀孕几率的，是手术治疗以后再怀孕比较安全。是治疗后在怀孕，以免引起怀孕几率下降。如果已经怀孕，巧克力囊肿是不会影响到胎儿发育的。如果怀孕后期没有骨盆异常可以尝试阴道分娩。
囊肿是由于体内激素分泌旺盛造成的，如果怀孕后，激素分泌会更旺盛，囊肿长得会更快，这样会影响胎儿的发育。囊肿是长在卵巢上的，卵巢功能受影响，也不容易怀上，应采取手术治疗。
巧克力囊肿术后是可以正常怀孕的。卵巢巧克力囊肿切除术后，应该定期进行超声检查，巧克力囊肿有复发的可能。一般三个月或是半年如果没有异常，就可以备孕的。手术可以采用微型电子腹腔镜下卵巢囊肿剥离术，是治疗卵巢囊肿较好的技术。