主要是果雌激素分泌出现异常，如果雌激素分泌出现异常，会影响到女性生殖器的发育，诱发子宫发育不良的重要原因。为了不出现内分泌失调，女性在日常生活中要做到，养成良好的作息时间，不熬夜，保持好的情绪等；为了避免营养不良，不能过度的减肥，而且要养成不挑食，注重营养的搭配等。
青春期阶段严重营养不良，可能导致内分泌功能紊乱，造成生殖器官及卵巢激素产生异常。有可能会阻碍子宫的正常的发育，造成子宫发育不良。如先天无子宫、子宫萎缩等都是子宫发育不良的原因。一般认为子宫发育不良的主要原因是由内分泌功能紊乱和营养因素导致的。应及时治疗，需要考虑多方面的因素，以确定病因进行对症治疗。
下丘脑/垂体功能异常导致卵巢不能排卵，无法分泌激素刺激子宫发育，故而形成子宫偏小。严重的贫血或某些代谢性疾病，比如甲状腺功能异常也会引起女性幼稚子宫。大多和内分泌因素有关。
子宫发育不良，多是一种先天性疾患，也是生殖器官畸形中最常见的一种。有些子宫畸形无任何自觉症状，月经、性生活、妊娠、分娩等亦均无异常表现，以致终身不被发现，或于体检时偶被发现。
子宫发育不良可能是先天性因素决定的，例如先天性幼稚子宫，另外还可能和青春期内分泌紊乱，卵巢的一些疾病有关系，特别是卵巢功能障碍引起雌、孕激素分泌不足所造成的。而卵巢功能降碍除了会使子宫发育不良外，更大的不利因素是这样的病人常常也没有排卵或者黄体功能不全。
子宫发育不良的原因有很多，大部分原因是由于先天性发育不良导致的，有些子宫畸形病人可无任何自觉症状，月经、性生活、妊娠、分娩等亦均无异常表现，以致终身不被发现，或于体检时偶被发现。子宫发育不良的治疗方法可以通过微创手术治疗，对身体没有伤害，而且恢复的比较快，不影响怀孕。