疏通输卵管有可能会出现疼痛，特别是输卵管堵塞或者通而不畅的，可能疼痛比较严重。有可能需要做宫腹腔镜手术，术中用麻药，是感觉不到疼痛的，而且术后疼痛的也比较轻。
宫腔镜疏通输卵管，如果不麻醉，患者会感觉到不同程度的不适或疼痛，如果打麻药，这个过程一般是不疼的。
在进行宫腔镜疏通输卵管的过程中，不打麻药，一般是会有不同程度的疼痛感的，而宫腔镜疏通输卵管的手术过程中，部分医生通常会给患者注射麻醉药物，比如通过静脉注入丙泊酚等麻药，以此来缓解手术过程中患者的疼痛。另外，使用了麻醉剂之后，人体的肌肉处于松弛的状态，手术能更容易进行。
输卵管检查的时候痛不痛，要根据输卵管通畅情况才可以决定。例如在月经干净后3天进行输卵管检查的时候，输卵管双侧都是通畅的，这时候可能不会觉得很痛，可以忍受，可能会存在有胀胀的感觉，在通水之后就会慢慢消退，不会影响身体健康，可以忍受。如果输卵管进行检查的时候，双侧输卵管都不通畅，这时候可能会存在有比较疼痛，不能忍受的情况发生，说明双侧输卵管堵塞，持续2-3天才会慢慢缓解。
输卵管疏通手术一般会有轻微的疼痛，不会很痛苦。
通常患者都可以承受输卵管疏通手术的痛苦，如果对疼痛比较敏感，建议患者可以做无痛的输卵管疏通手术。要注意手术的前三天禁止性生活，手术需要去正规医院就诊，手术后需要在医生指导下服用消炎药防止感染，术后定期去复查，检查恢复情况。
治疗期间不要吃辛辣刺激性的食物，避免性生活。
通过通水治疗疏通输卵管后，病情复发的机率还是很高的，并且病情还有较原有病情加重的可能。若近期内不打算怀孕，在打算受孕前三个月做输卵管造影检查以彻底明确输卵管的病情如何。