第二代试管婴儿应称为卵母细胞胞浆内单精子注射。与第一代试管婴儿的区别主要是精子和卵子结合的方。第二代试管婴儿主要由于男方精子质量不好，所以胚胎学家从有限的精子中选取质量好的精子，然后通过超细的针，在显微镜的帮助下，人工将精子注射到卵子内。精子的来源可以是新鲜或冻融的精子，也可以是附睾、睾丸穿刺取出的精子。
试管婴儿流程男女双方的体检，女方超促排卵和男方调整精子活力，取卵，实验室的培养以及胚胎移植技术，黄体支持，因为试管婴儿必定会造成一定的黄体功能损失，所以通过补充黄体酮来进行黄体支持。
女性在一个月经周期内，只有一个成熟的卵子排出，为了增加试管婴儿的成功率，会注射促排卵药物，获取10个-15个健康的卵子。不过用促排卵药物，有可能导致卵巢过度刺激综合症，不要私自使用，将精子和卵子放在一个培养皿中，大约8小时。可以筛选有基因缺陷的胚胎，胚胎在经过3天-5天的培养后，选出质量好的1-3枚，植入子宫。试管婴儿并不能避免宫外孕，因为胚胎在子宫是游走的，跟正常的受精着床一样。
男女双方通常需提前1-2个月进行全面检查，如男方需化验精液等，女方需行妇科检查、诊刮、腹腔镜、抗精子抗体、肝功能和乙肝两对半、血常规分析和出凝血时间及基础内分泌激素测定等，具体检查项目因人而异。
临床上辅助生殖技术有人工授精与试管婴儿。试管婴儿就是取女性的卵子与精子在体外形成受精卵，然后在子宫内膜厚度允许的情况下，也就是合适的时间移植入宫腔，在医生指导下服用黄体酮与补佳乐进行保胎治疗。
男女双方通常需提前1-2个月进行全面检查，如男方需化验精液等，女方需行妇科检查、诊刮、腹腔镜、抗精子抗体、肝功能和乙肝两对半、血常规分析和出凝血时间及基础内分泌激素测定等。促排卵、监测卵泡。取卵、取精、胚胎体外培养并移植。如要做三代试管婴儿，还需将胚胎冷冻后，检测筛选出没有携带疾病相关性的囊胚后再进行移植。