巧克力囊肿一般是需要医治的，如果放任其继续生长，他会有一个破裂或者癌变的风险。巧克力囊肿有良性和恶性之分。区别是囊肿直径是否小于三厘米。囊肿直径小于三厘米，就为良性囊肿。大于三厘米，则为恶性囊肿。巧克力囊肿如果小于三厘米，这个比较轻微。但是他也不可能会自愈。还是得采取一定的药物治疗。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症中最常见的一类，卵巢巧克力囊肿随着病程的延长，囊肿内积血的不断增加，囊肿体积也随之增大。当囊腔内积血过多、压力过高时，可撑破囊壁薄弱部卵巢巧克力囊肿分，发生囊肿自发性破裂，囊内流出部分积血，压力降低后，囊壁破口常可自行复合。确诊为巧克力囊肿，一定要及时治疗。以免错过治疗时机。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，应该来说去当地医院检查下，在医生的嘱托下，进行积极治疗，服药期间不吃辛辣刺激的食物，平时多喝水，温水清洗外阴，保持局部清洁，内裤开水消毒，不要有性生活。
巧克力囊肿不会自行好的，如果能放任其继续生长，会有一个破裂或者癌变的风险。巧克力囊肿有良性和恶性之分。判断他们的依据其囊肿直径是否小于三厘米。囊肿直径小于三厘米，就为良性囊肿。大于三厘米，则为恶性囊肿。巧克力囊肿如果小于三厘米，也采取一定的药物治疗。
可以采用手术的治疗方法，对于散在的比较小的宫颈腺囊肿一般不需治疗，只要每年检查即可。对于密集的较小的纳氏囊肿或比较大的囊肿，可考虑光疗、激光、微波、自凝刀等物理治疗。对于较大的突出于宫颈表面的，可考虑电刀切除治疗。
巧克力囊肿也是一种比较常见的妇科疾病，一定要及时去检查并确诊，以免耽误病情，这种疾病是不可能自愈的，的主要表现就是进行性的痛经，一般治疗有药物治疗和手术治疗，对于囊肿比较小或者是有生育要求的年轻女性。