如果没有不适的症状，46岁停经一般不需要进行特殊的治疗；如果有不适的症状，可能需要通过使用药物、调整饮食等方法进行治疗。
正常情况下，女性绝经年龄在45岁到55岁都属于正常的，这个时候卵巢已经萎缩了，不需要特别处理的，但是这个时候绝经的话，会导致体内雌激素水平不足，进而导致骨质疏松，同时多伴有更年期综合症，比如烦躁、潮红、失眠等不适，可以选择服用大豆异黄酮调理下，或者是多吃些富含植物雌激素的食物，比如黄豆、小米、黑豆、蜂皇浆等，再配合钙片调理下。
首先来说第一个因为月经已经停了很长时间了，如果是怀孕是应该能查到的，那么需要第一个是做一下血液方面的检查，动态观察血hcg和子宫附件超声情况，正常宫内孕血hcg是呈隔日翻倍增长的，宫外孕增长慢，如果左侧卵巢无回声进一步增大，宫内还是没有孕囊，可以确定是宫外孕。
《黄帝内经》上说，女人在四十九岁左右，体内的各个器官都会逐渐老化，尤其是卵巢功能会慢慢衰退，所以会影响到月经周期。女性停经后要注意保持情绪愉悦、积极乐观、生活规律，不要过于劳累。
停经后患者可能会短暂地觉得心烦意乱，但随着时间的流逝，患者的心情会逐渐平复。因此不用过于担心，只需要保持健康的生活方式即可。
如果是怀孕，停经46天，应该有早孕反应，比如恶心呕吐，厌油腻，全身无力头晕，嗜睡，但是也不能确定是否怀孕，及时进行人绒毛膜促性腺激素的检测，必要的时候46天可以做彩超了，彩超可见宫腔内孕囊发育的情况，并可见胎心和胎芽。
46岁突然停经，未必一定绝经了。女性偶尔一次月经不准，问题不大，尤其46岁突然停经，也问题不大。因为在国内，妇女绝经平均年龄是在49岁左右。像月经不准，停经2-3个月来一次，最后逐渐绝经，都属于正常的。即便是突然停经不再来了，也问题不大，因为绝经年龄可能稍早一些。如果身体其他各项检查没有异常，出现停经问题不大。46岁突然停经，不用特别担心，在排除怀孕的情况下，可以观察。
治疗月经不调首先应该找出不调的病因，生殖内分泌轴系中各个环节都必须处于正常状态，任何一个环节出现问题那么它所对应的激素水平也会有所改变，所以对于月经不调的女性必须得检查激素水平和卵巢功能，上医院做电化学发光激素六项和阴道四维彩超，因为调经药都是激素类药，对身体各方面影响不说还对于未查清病因的内分泌是一个挠乱过程，如果出现了闭经或者是内分泌结果严重紊乱还得考虑做垂体兴奋试验的检查的。