需要三个月左右才能治好。巧克力囊肿是子宫囊肿的一种，属于良性病变，会伴随有增生、转移、复发等情况的出现，而且会造成痛经、月经失调等，因此建议还是及早治疗比较好，需要服药三个月左右进行巩固治疗，另外需要随时复查。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，临床原则是手术治疗，现代医疗水平先进，可以不用开刀，直接用微创术，在腹部0.5CM小切口，入院到出院三至五天，将巧囊剥离，再在术中用药物及生物防粘膜，这样可以不再复发。
治疗好看治疗方案与时间，巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，如果不治疗囊肿会不断的增大，而且会影响到月经，巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，是女性较常见的病变之一，如果囊肿较小可以中药治疗，治疗时间因人而异，囊肿较大需要手术，不管是哪种治疗，均有复发可能性。
对于治疗巧克力囊肿目前的中药疗效也不是太高的，要找一个专业的医生和一个好的治疗方案，服用中药一个疗程看看，如果说一个疗程后仍旧是这么大或者说增大了，那么也不用再保守治疗了，只好选择手术来治疗。多久能治疗好要看怎么选择了。
巧克力囊肿治疗时间是不确定的，要看病人的病因以及地方，不同地方治疗费不一样的，巧克力卵巢囊肿治疗方法主要采用药物和手术治疗。药物治疗包括：假孕疗法，假绝经疗法等，但只能缓解症状控制发展，停药后，即复发，故对卵巢巧克力囊肿多主张手术治疗。