巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症造成的，是由于子宫内膜在卵巢上进行了生长，随着月经周期的改变而出现脱落的情况，在巧克力囊肿术后是需要在医生指导下应用药物的应用，假绝经疗法或者是假孕疗法，或者是短时间内进行怀孕，促进子宫内膜的萎缩，患者在医生指导下规律用药进行治疗，定期上医院进行复查，观察身体恢复的情况。
巧克力囊肿破裂后应立即就医，通过手术进行治疗。
巧克力囊肿破裂是子宫内膜异位症的一种病变。正常情况下，子宫内膜生长在子宫腔内，受体内女性激素的影响，每月脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿，即巧克力囊肿。通常巧克力囊肿破裂后，应立即就医，通过根治性手术进行治疗，并辅以药物治疗。
如果是破裂建议马上手术，因为囊液播散至盆腹腔会引起急腹症，还可能种植发生子宫内膜异位导致盆腔腹腔粘连，影响以后怀孕。卵巢巧克力囊肿破裂，比较多，那么就会导致休克。需要考虑尽快的采取手术，如果是出血不多，可以考虑采取保守。
巧克力囊肿一旦破裂就会使得输卵管被堵，导致卵巢的排卵功能无法正常运行，降低受孕几率。积血流到盆腔就会使得出现小腹疼痛、月经不调、性生活疼痛等现象，并且导致盆腔器官粘连在一起，引起腹膜炎卵巢巧克力囊肿又名卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。卵巢巧克力囊肿虽然是良性疾病，却有增生、浸润、转移及复发等恶性行为。
巧克力囊肿破裂会导致下腹剧痛疼痛常从一侧开始，以后扩散至全下腹，并且伴有肌紧张、反跳痛等腹膜刺激征。巧克力囊肿就是子宫内膜异位囊肿内含陈旧性的深褐色的经血，看起来很像巧克力酱。
1个月，但是具体的时间还是需要个人后期恢复情况决定的，可以选择听从医生的。巧克力囊肿可在宫腔镜的窥视下看到子宫内膜样组织，这种囊肿内潴留的陈旧血瘀如巧克力糊状的颜色。