卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种。是由于，具有生长功能的子宫内膜在卵巢开始生长，并且规律性的脱落。一般可以采用开腹手术费用大概在2000-3000元也可以做微创手术。
卵巢巧克力囊肿手术费地区不同价格不同以当地医院为准。包括，术前检查费用、手术治疗费用、术后消炎费用等。但是，主要费用受选择的治疗方案不同，差异会比较大，现在治疗巧克力囊肿的方法主要有：药物治疗、传统开腹手术、宫腹腔镜手术治疗。
卵巢巧克力囊肿的治疗费用一定程度上不同的病人病情不同，采用的治疗方法也不同，需要根据病人的具体情况来定。注意休息，调节情绪，保持良好的睡眠及饮食均衡，多进食新鲜水果蔬菜，劳逸结合，避免过度劳累、剧烈运动及紧张焦虑。
巧克力囊肿主要的临床表现是痛经，并且是进行性的。巧克力囊肿的治疗通常采用手术治疗，而最常用的是腹腔镜手术，费用都不同，但不同级别的医院，不同的区域费用会有所不同。当地咨询会更准确。
巧囊穿刺手术各个医院的收费标准不一样的，去正规公立医院比较安全的，收费也比较合理的。术后一个月内是禁止性生活的，大部分来说，禁止性生活主要是为了预防感染和预防子宫内膜异位症复发。一个月以后再去一家医院进行复查。大部分来说应该没有太大的问题。
由于这种疾病可以在盆腔的各个位置出现，所以手术的方式也是不尽相同的，正常如果是开腹手术，费用可能会比较低，大约在10000元左右。如果是使用宫腔镜手术，费用可能会在15000元左右。另外，术后常规应该使用药物，防止双侧卵巢巧克力囊肿复发，这种药物使用3-6个月，价格也是比较高的。