女性在来月经的时候，出现右侧卵巢的疼痛现象，有可能是卵巢巧克力囊肿所引起的，是女性卵巢子宫内膜异位症，是正常子宫内膜种植到卵巢上所引起的。部位的子宫内膜，同样具有正常部位子宫内膜的一些特性，可以受到体内周期性的激素水平变化的影响。
如果是在月经期出现疼痛，称为痛经，就不一定是囊肿的原因，如果月经已经干净了，出现明显的疼痛有囊肿的情况下，首先要注意检查是否出现了卵巢囊肿蒂扭转，是需要手术的。需要及时去医院检查。
卵巢囊肿月经时疼痛，需要随时检查，因为卵巢囊肿有可能长大了压迫疼痛。卵巢囊肿会随着时间逐渐发展，以至于当运动或者静坐后站起，也会感到疼痛。病情已经比较严重。因为囊肿内的积液因为重力作用使卵巢下垂，当运动时就有一种坠痛，传统治疗中对于卵巢囊肿治疗都采取手术切除卵巢的办法进行治疗。
左侧卵巢囊肿月经走后几天疼考虑是排卵期腹疼，排卵期小腹轻微疼痛多是生理性改变。可以喝红糖水，注意保暖，从而改善卵巢和子宫的功能，缓解疼痛。如果排卵期出现剧烈腹痛，考虑有妇科炎症，可以到医院进行妇科检查，应做白带常规，妇科彩超等相关检查，以明确诊断，后给予相应治疗，比如炎症的抗感染治疗，比如囊肿的手术治疗。
很多体寒的人来月经的时候都会有小腹疼痛的这种症状，建议可以拿一个暖水袋暖和一下腹部，同时能喝一点姜汤水，千万不要吃一些凉的东西，一定要注意保暖。宜多食温性食物。
在生理期期间，子宫内膜壁的废弃物开始脱落并且排除，过程当中有可能会刺激到卵巢囊肿，导致出现强烈的腹痛感。注意好经期的保暖，可以服用一些缓解痛经的药物观察，同时也要及时的治疗卵巢囊肿，如果囊肿大建议手术。