按摩。按摩足三里穴。用一只手的掌心按准膝盖的顶部，中指下伸的顶端，向外一横指即是三里穴。可以用针灸，也可以用拇指反复按压。按摩指压点。足部含有一些指压点，被认为与骨盆部位的气路相连。在脚踝双边的凹陷处，皆有指压点。
可以根据先看囊肿大小，或许可以先开刀彻底切除囊肿，另外少吃补品类食物，避免囊肿增大。象是豆类，含有雌激素类的就要避免。也可在月经来潮期，多喝热红糖水。缓解痛经现象。
巧克力囊肿手术后还会痛经，在手术之后还会有痛经的症状，这主要是因为本身的痛经并不是因为卵巢肿大所导致的，或者说痛经除了巧克力囊肿之外还有别的诱发因素，所以会导致做完了巧克力囊肿手术之后依然会痛经。
子宫囊肿的治疗一般可分为两种，首先用西药治疗子宫囊肿并不困难，但是必须先检查是不是病毒引起的炎症。检查后，可以相应地进行治疗。如果囊肿不易消退，可以先穿刺，然后通过激光和冷冻。
卵巢囊肿术后痛经需明确具体的病因，再进行治疗。
卵巢囊肿术后出现痛经的情况，可能是由于囊肿没有切除干净导致，此时就需要再次通过手术治疗卵巢囊肿。但是也不排除是和其他的妇科疾病有关，如子宫内膜异位症、盆腔炎等，就需要再做详细的影像学检查，明确具体的病因，找专业的医生对症治疗。
卵巢囊肿积极治疗预后良好，但如果治疗不及时，会诱发更为严重的疾病，如卵巢破裂、蒂扭转、感染、恶变等。
卵巢囊肿引起痛经可以服用激素药物和手术来治疗。
卵巢囊肿是生殖系统中比较常见的良性肿瘤，是卵巢激素分泌异常后引起的，病情较轻时可以服用激素药物治疗可以促进囊肿萎缩，卵巢囊肿严重影响月经时可以选择手术治疗。治疗卵巢囊肿之前最好进行超声波检查来判断病情，可以针对性的制定治疗方案。
在治疗卵巢囊肿期间还要注意外阴部位的清洁和卫生，最好使用消炎的药物配合温热水来调配进行外阴部位清洗，能减少感染。