一般情况下，肝囊腺瘤可以选择肝段切除术、局部放疗穿刺引流等方法进行治疗，具体内容如下：
肝囊腺瘤是一种肿瘤性肝脓肿，在肝脏中很罕见，其发生于左、右半肝的可能性相当。因为肝囊腺瘤会发生癌变，从而导致胆囊腺瘤的发生。肝脏的大小和部位可以采用肝段切除术。如果不能进行外科治疗，可以采用局部放射治疗，也可以在超声波的指引下进行穿刺取出囊肿积液，然后注入无水酒精或化学药剂。
卵巢出现了囊腺瘤，一般是选择手术的，看看是否腹痛或者伴随腹部不适的情况，可能会影响导致正常经期或者导致不良反应的，应该多注意休息，调理身体，注意饮食，不要吃辛辣食物。
甲状腺囊腺瘤可以通过保守治疗、手术等方式进行治疗。
甲状腺囊腺瘤的临床治疗主要是通过随访来进行观察，但如果是恶性的，或是由于囊腺瘤的体积太大，给患者造成了压迫，例如吞咽困难，异物感等，则需要手术摘除囊腺瘤。甲状腺囊腺瘤多数是良性的，不是功能性的，临床上要做检查才能确诊，所以医生会建议病人定期复查，主要是检查甲状腺激素水平，以及甲状腺彩超。
对于胰腺囊腺瘤和囊腺癌，一旦发现首选手术治疗。根据肿瘤的大小和之前对比，还可以考虑选择不同的手术方式。囊腺瘤的手术方式主要是包括局部的腺瘤摘除术，保留脾脏的胰体尾切除术，保留十二指肠的胰头切除术，保留幽门的胰头十二指肠切除术以及胰头十二指肠切除术。
胰腺囊腺瘤，应该做手术治疗。胰腺囊腺瘤是胰腺的良性肿瘤，胰腺癌则是原发于胰腺的恶性肿瘤，良恶性的差异是两者之间的主要差别。虽然胰腺囊腺瘤的生长速度较为缓慢，但是，由于增大的囊腺瘤依旧会产生肿瘤压迫周围组织，阻塞主胰腺管，牵拉后腹膜等效应。
以手术切除治疗为主，搭配西医药物治疗就可以了，饮食需要注意，多喝水，忌辛辣等刺激性食物。淋巴乳头状囊腺瘤主要好发于腮腺后下部分，发病早期没有任何的症状大多数人都是在无意当中发现的，主要症状是表面光滑，质地较软，活动性肿块。