通常来说，肝穿刺活检的危害有导致出血、误诊、加重疾病等。
1、出血：肝穿刺活检可能导致患者穿刺点出血、腹腔内的出血，引起肝脏损伤、肝内感染、腹腔感染。
2、误诊：肝穿刺活检可能无法明确其具体的病理，取样的组织过少可能出现误诊情况。
3、加重疾病：肝穿刺活检容易造成肿瘤破裂、转移的可能，导致肿瘤通过针道的转移。
肝穿刺后诱发感染是肝穿刺最严重的危害。由于在操作过程的失误，导致细菌等病原体进入到病人体内，从而引起严重的炎症反应，导致出现感染的症状威胁到病人的生命健康。此外，对肝癌病人进行肝穿刺的过程中，可能会引起癌细胞的扩散，造成种植转移，产生严重的后果。
甲状腺穿刺活检的危害有疼痛，出血等。甲状腺穿刺术是一种用来诊断结节性甲状腺疾病的方法。甲状腺细针抽吸活检现在已经确定为准确性很高的诊断方法，常规用于结节性甲状腺疾病诊断过程的第一步。
穿刺活检的注意事项有在医师的指导下，立即用沙袋或手按压穿刺部位，避免活动性出血。术后30分钟进行彩超复查，检查穿刺部位有无血肿或者积液，从而判断有无出血。术后观察6小时，若无出血现象，则可恢复正常活动。肝穿刺或者肾穿刺术后应给予注意，彩超检查无血肿或积液，患者应卧床休息观察6个小时，避免出现迟发性出血。
有很多乙肝害怕进行肝穿刺检查，担心会伤害身体，肝穿刺有危险。其实，对于肝穿刺有危险的担心是多余的，肝穿刺并不可怕，在肝穿刺检查前要进行很多其他配合检查，如：血小板计数、出血时间、凝血时间等。只要这些检查都正常无误的进行，那么肝穿刺检查也是非常安全的。