扁平足跑步的危害主要是加大脊柱之间以及下肢关节软骨之间互相冲击。
正常人足弓在很大程度上起着缓冲人体脊柱与下肢关节软骨之间冲击力作用。扁平足长时间大幅度剧烈地蹦跳活动可能会加大脊柱之间以及下肢关节软骨之间互相冲击伤害。扁平足患者不宜进行剧烈地蹦跳活动，特别是肥胖者和体重较大者，如喜欢跑步可穿着平底软底气垫鞋或垫带足弓矫形气垫鞋，短时短慢跑也可。
一般情况下，扁平足可以跑步，具体内容如下：
由于扁平足没有足弓，缺乏缓冲力量，会造成疼痛和行走的姿态发生变化，不过也可以使用足弓垫进行跑步。跑鞋最好选择专用的运动鞋，选择柔软的专业的塑料跑道。足弓垫、跑鞋和塑料跑道可以最大程度地减轻扁平足引起的疼痛，同时还要适当地减少跑动的长度，在适量的逐步增加。
扁平足因为没有足弓，所以对于缓冲力量有一定的缺失，这种会逐渐导致疼痛以及走路姿势的改变，但是也可以跑步，可以用足弓垫辅助跑步。跑步的鞋子选用专业的鞋子，在比较软的专业塑胶跑道上跑步。
扁平足走或跑久了脚容易疼和累，晚上回去记得用热水泡脚，缓解疲劳。刚开始一段时间会特别累，慢慢就好了，就不用泡了。可能偶尔会拉到脚弓处的那条筋，会疼。但跑多了，你就知道应该用脚的哪部分着地，才能避免拉到。跑多了以后，也就不疼了。
遗传扁平足可引起活动受限和锻炼，久站或久走均有关节胀痛。
在临床上，大多数人群中都存在着遗传扁平足现象。比较严重的会造成膝关节、髋关节等连锁反应，伴跖筋膜炎者、跗骨窦综合征等，对个人健康的影响。扁平足在青少年时期就开始发生并逐渐发展成慢性疾病，对社会造成了很大负担。此外扁平足者因足弓塌陷，无论是行为姿势还是跑步姿势，都有别于一般人，极大地影响了个人形象。