腱鞘囊肿若无明显症状，无需特殊处理，并注重休息，忌久站久走，忌手指、手腕用得太多，同时切忌重复揉搓按摩，部分腱鞘囊肿可消失，约三至四周。对于较大的腱鞘炎性囊肿可采用局部药物注射和切开引流的方法来达到治愈的目的。若腱鞘囊肿渐大，手术切除可考虑。
此外，腱鞘囊肿患者应该注意避免摩擦患处，以免加重病症，不利于腱鞘囊肿恢复。
腱鞘囊肿多数病例无须特殊处理，主动注意休息，以免局部受创伤，切忌重复推拿按摩。一旦发生腱鞘囊肿时，可以采取保守性的方法来治愈，主要包括手术以及药物治疗等方面。如局部有某种疼痛表现，并压迫血管神经，导致相应病症，或腱鞘囊肿渐大，此种情况需积极处理。
此外，患者日常应该避免摩擦患处，以免导致病症持续加重。
可以在门诊手术室就可以进行的。跟一般软组织手术愈合时间一样，一般伤口愈合要两个星期左右，其间一般要注意切口卫生，因为是无菌手术，一般不需要抗生素预防感染，预防肌腱粘连，3到4周一般恢复正常。
腱鞘囊肿按多久都无法治愈。
腱鞘囊肿推拿无法根治，只不过，们对某些囊壁比较薄的囊肿，按摩时可能把囊壁压碎，使囊液向外渗漏，体积变小罢了，这样以后囊肿反复发作的可能性还会更大。所以说要想彻底根治这个病还得做一个小手术。若腱鞘囊肿扩大至已影响患肢之形态与功能，那们就是推荐手术治疗，把囊肿摘除，术中需寻找其蒂部，结扎，这使得其手术后复发几率很低。
腱鞘囊肿一般受压后不会消失。
但部分薄壁囊肿受压后可能破裂，暴露后囊肿变小，可能导致囊肿外观消失。如果按压后腱鞘囊肿消失，一般认为是腱鞘囊肿破裂，但这种情况下，腱鞘囊肿容易再次复发。一般来说，腱鞘囊肿推荐手术治疗，彻底切除囊肿更好。但需要注意的是如果患者病情较重，为顽固性的腱鞘囊肿，则不能采取揉按的方式治愈。如果揉按不当或用力挤破还有可能会对其他正常组织造成损伤，甚至增加感染风险。
腱鞘囊肿手术一般2个星期左右能恢复。
腱鞘囊肿通常出现在手上，在肢体的末梢，例如手腕，手指，脚背，通常需要两个星期的时间，之后三天换一次，两周拆线，拆线之后一星期内要注意不能接触到水和沐浴，这时候可以进行适度的屈伸运动，但要注意不要做过于频繁的屈伸关节，以免出现肌鞘囊肿。恢复期间，患者应避免提拿重物，以免影响手术治疗的效果，导致恢复时间延长。