临床上，如果是急性脑膜炎，首先要做常规检查，比如血液分析、c反应蛋白、红细胞沉降率、降钙素原、病毒筛查、肝肾功能等。
同时还要抽取脑脊液进行化验，看看是病毒性脑膜炎还是细菌性脑膜炎、隐球菌脑膜炎。还需要做头颅磁共振检查，看看是脑膜炎还是脑膜脑炎。如果患者还有癫痫，需要做脑电图检查，排除脑膜炎等继发性癫痫的可能。
脑膜炎可以通过穿刺、磁共振等检查明确具体情况。
在确诊脑膜炎时，要根据病人有没有头痛、恶心、呕吐、颈部肌肉麻木、抽搐、谵妄等神经系统的表现明确具体情况。如果有以上的表现，可以进行穿刺检查，确定脑脊液的性质和病因。如果是脑膜炎，可以通过磁共振来检测，但是很难对其进行明确的分类，因为只是因为脑膜炎症的变化而导致的，如果是轻微的脑膜炎，可以通过药物来缓解，如果病情加重，会危及到病人的性命。
脑膜炎诊主要结合临床症状及脑脊液检查和头颅核磁共振检查确诊。因为该病的诊断在脑脊液检查中主要表现为脑脊液淋巴细胞数轻，中度增高，早期以多形核细胞为主，脑压可正常或增高，复查还是要做腰穿的，如果腰穿结果正常，临床症状完全消失，可以认为治好。日后注意提高免疫力，预防感冒。
脑膜炎的诊断要综合考虑患者的症状、体征、头颅CT、血常规、脑脊液的常规检查、脑脊液的免疫检查等。
脑膜炎的病人有可能会有头疼、恶心、呕吐、颈部僵硬等表现。如果头部CT显示有脑水肿，没有其他的症状，脑脊液细胞学和病原学检查有致病微生物，可以诊断为脑膜炎。脑膜炎一旦确诊，应积极使用敏感的抗生素进行抗感染治疗，并要注意减少颅内压、改善脑代谢、缓解脑水肿等。
CT、MRI检查。病变早期CT或颅脑MRI检查可正常。有神经系统并发症时可见脑室扩大、脑沟变窄、脑肿胀、脑移位等异常表现。并可发现室管膜炎、硬膜下积液及局限性脑脓肿。增强MRI扫描对诊断脑膜炎比增强CT扫描敏感增强。