一般情况下，需针对脑炎病人这一不同病原体感染情况，决定病人特定用药时间。
若病人者感染病毒，通常情况下，病人的症状不严重的话，总体状况良好，这类病人通常这种单纯疱疹病毒感染为自限性。另外一种就是单纯疱疹病毒与其他类型的疾病引起的脑炎相比起来都比较严重，因此这两种病症对于患者来说都比较难控制，所以必须及时对其进行治疗，这样才能够提高疗效。抗病毒通常治疗3周，约1个月，但还必须根据病人具体情况而定，病情较轻者可用药时间缩短，但若病人病情严重，施用药物治疗时间相对较长，例如，有些是结核杆菌引起结核性或脑膜脑炎，这类病人需使用抗结核，抗结核药物疗程则较长，有些病人通常最少用药6个月或更长。
脑炎患者口服激素需要多长时间，如果是病毒感染所致，那么服用激素的时间也会相对较短。
但如果是由于免疫系统不正常而引起的自体免疫性脑炎，那么服用激素的时间就会长一些。另外，在使用激素的时候，还要注意患者的某些症状是否消失，是否存在胃溃疡、出血、骨质疏松、电解质紊乱等，因此需要根据病情来判断是否需要长期服用激素。
病毒性脑炎一般都是单向发展，所以很难再出现。
不过还需要做进一步的检查，一般情况下，在治愈之后2-4个星期可以进行复查。复检主要是检查病人的心理状况，有无头痛、恶心、呕吐等表现，同时还要检查是否有脑膜刺激征象。辅以脑电图，判断是否有脑电活动是否正常。在发生脑炎的过程中，如果出现了脑部的MRI异常，就必须要做一次头颅MRI检查。
脑炎术后同房要看自己的恢复情况，可以适量同房。出现脑膜炎需要积极的消炎，营养脑神经治疗，注意监测好生命体征，平时增强个人体质，避免着凉感冒等，注意多休息。生活要注意规律及补充各种营养。
术后一般疼痛3－4天，在一周左右基本疼痛消失，这与个人体质有一定的关系，另外每个人对疼痛的耐受力也不同。术后时间短如昏迷者需保持呼吸道通畅，清醒后要保证充足的营养摄入。