脑CT和磁共振的区别通常是比较大的。
脑CT和脑核磁是两种截然不同的检查方式，他们的关注点也不一样，虽然可以看到相似的地方，但却有着很大的差别。脑部CT是出血性疾病的首选，而脑部核磁共振则是缺血性疾病的首选。此外，磁共振检查所需要的检查时间会比头颅CT要长很多，一般脑CT检查只需要数10秒或者1分钟就能完成，而磁共振检查通常需要十几分钟，甚至更长时间。
ct产生的横断位图像，核磁共振不仅可以有横断位图像，还可以有冠状位和矢状位图像。ct有骨伪影的干扰，而磁共振没有干扰。ct检查时间较短，对外伤性病变、急性脑血管病是首选检查，没有特别的禁忌症。而磁共振对装有心脏起搏器的病人不能检查。
磁共振与核磁共振是相同的，无区别，磁共振产生的原理为原子核内部的核跟随体外磁场共同脉动。核磁共振与核武器、核辐射等产生的危害是不可同日而语的，核磁共振只是产生一个较小较轻的核磁场。
磁共振和增强磁共振有区别。磁共振是直接核磁平扫，增强核磁共振是用造影剂后进行平扫这两者的去别在于，磁共振只能看到组织，而增强核磁共振对组织肿块进行检查更加彻底。
核磁共振和CT检查有较大区别，首长们的成像原理就不同，其次就是我们检查的适应症不同。核磁检查具有更高的软组织分辨率，更适用于中枢神经系统等的检查，而CT成像的速度比核磁共振快，所以更适用于有生理运动功能器官的检查。
磁共振检查是利用氢质子成像，氢质子带正电荷并作自旋运动，产生磁场，并具有极性。人体含有丰富的氢质子，其极性排列自由无序。CT增强扫描是通过静脉高压注射造影剂，在CT机的扫描下，观察动脉期、门脉期、平衡期及延时期病灶的强化特点来鉴别病灶的性质。
