生理性腹泻应该对孩子增强护理，大便之后及时清洗臀部，抹上爽身粉，保持皮肤干爽，避免引发湿疹或者局部的感染。
对于明显腹泻的患儿，腹泻次数较大可以换用免乳糖奶粉。但如果腹泻较轻，建议继续母乳喂养，可适当补充锌剂、微量元素，生理性腹泻是由宝宝对乳糖不耐受所引起的，这种情况到1岁左右就会自然痊愈，一般不需要特殊治疗。
一般情况下，幼儿生理性腹泻通常不是疾病。如果幼儿的生理性腹泻的情况不是很严重，家长不用过于担心，这种情况通常不用进行特殊治疗，一般继续正常进行母乳喂养即可，但需要注意幼儿的身体情况。如果幼儿生理性腹泻的情况比较严重，且长时间未得到改善，家长应及时带幼儿去医院就诊，在医生指导下给其口服蒙脱石散等药物进行治疗。
生理性腹泻应当采取以下措施。
生理性腹泻是因为母乳中含有一些能够抑制乳糖酶的物质，导致孩子对乳糖的不耐受，导致出现了腹泻。如果无其他不适症状，一般无需进行特殊治疗。如果病情较为严重，可以在医生的指导下进行治疗，从而帮助缓解不适症状。
日常生活中，应当注意多饮水，多食用蔬菜和水果，饮食中适当增加纤维素。
生理性腹泻是不需要打针吃药的，如果是母乳喂养的，建议喂奶的时候每次都喂两边，不要因为吃一边都吃不完就只吃一边，后奶的营养比较丰富，如果摄入后奶很多的话会加重生理性腹泻症状。
如果腹泻过多，可以适当加用收敛剂或中药。若非必要，尽量还是少用或者不用药。对于明显腹泻的患儿，腹泻次数较大可以换用免乳糖奶粉。但如果腹泻较轻，建议继续母乳喂养。
这个生理性腹泻一般常见于小于六个月的宝宝，母乳喂养的常见的，这个大便可为稀便，无粘液脓血，一日数次~10余次不等，不伴有发热、呕吐、腹胀等症状，粪便常规检查无异常。宝宝精神好，吃奶好，体重稳定增长，不影响生长发育，这样的情况下一般无须治疗，添加辅食以后就可以改善的。