通常情况下，益生菌治消化不良。具体情况分析如下：
乳酸菌素片、双歧杆菌三联活菌胶囊等是临床上比较常见的益生菌，乳酸菌、长型双歧杆菌、保加利亚乳杆菌等都具有调节肠道菌群的作用，具有抑制和杀死有害菌的作用，还能促进肠道蠕动，帮助食物消化吸收，改善消化不良、腹胀腹痛、肠鸣呕吐、食欲不振等不良反应。由于益生菌是活的，要用40℃以下的水冲服，否则会影响到它的活性。
消化不良的患者可以服用益生菌 。
消化不良的患者可能存在菌群失调问题，因此临床上通常会给这类患者开取益生菌处方，益生菌可以直接补充腹泻和消化不良导致的有益菌的缺乏，促进营养物质的消化和吸收，提高机体免疫力、缓解机体的炎症反应、保护肠道粘膜屏障，能抑制肠道内致病菌，有缓解腹泻便秘的作用，和存在脾胃虚弱、脾胃湿热 、脾胃虚寒等体质问题的患者亦可以使用益生菌调节。
如果患者的肠胃蠕动能力较弱，但是偏食油腻、脂肪含量较高的食物，或经常暴饮暴食，只吃益生菌的效果可能不会特别明显，此时应以改善饮食、调整生活习惯为主，如少吃多餐、多食用膳食纤维食物，每天适当运动，此时再使用益生菌和四磨汤合用会有更好的效果。四磨汤口服液可以有效促进肠道蠕动、促进消化，与益生菌联合使用，对于消化不良的患者效果更佳。
一般情况下，治疗消化不良、腹痛腹泻、肠胃炎、肠粘膜破损等疾病的治疗有双歧三联活菌胶囊、枯草杆菌二联活菌胶囊等。
这类药物通常包含的保加利亚双歧杆菌、嗜血链球菌、枯草杆菌、屎肠球菌等多种有益菌，具有一定的抑菌活性。但是患者还是需要在医生的指导下服用药物，不能自行决定用药，以免导致用药不当，影响患者的病情恢复。
儿童消化不良吃双歧杆菌三联活菌胶囊、乳酸菌素片或者枯草杆菌二联活菌胶囊等益生菌比较好。
这些益生菌都属于活性的益生菌，吃了之后能够促进儿童的肠胃消化，改善消化不良的现象，并且还可以调理儿童肠道菌群失调的现象，但是益生菌并不是吃得越多越好，一定要根据病情的需要在医生的指导下服用。
患病期间，要注意以清淡饮食为主。
益生菌对消化不良只起到辅助效果。益生菌里边的菌群活菌比较多，能够调节肠道的菌群失衡，从而改善消化不良的情况，对轻微的便秘可以起到辅助效果，如果患者便秘比较严重，一般效果不太理想，需要通过口服药物的方法调理饮食，搭配按摩综合治疗，长期的便秘很容易导致肠道息肉增生，会出现肛门破裂，可以去医院做肠道检测，查看肠道是否出现异常，查明原因，配合相应药物治疗。
儿童消化不良可以喝益生菌。
益生菌能够促进胃肠道的消化，改善胃肠道菌群失调的现象，同时还可以增强儿童肠胃的免疫力，对于辅助治疗消化不良有一定的效果。儿童消化不良期间除了喝益生菌，还可以在医生的指导下服用醒脾养儿颗粒调理肠胃的功能，效果会更好一些。
平时可以适当的进行锻炼，也能够促进胃肠道消化。