桥本氏甲状腺炎目前尚无特异性治疗手段，大多数病人无需处理，诊断后可定期追踪观察。
桥本氏甲状腺炎属于自身免疫性甲状腺炎的一种，因自身免疫功能紊乱所致甲状腺疾病，它是遗传因素与环境因素相互作用的结果，临床上以大面积免疫紊乱为主要特征。存在临床型及亚临床型的甲减，以甲状腺功能下降为主采用甲状腺激素替代治疗，老年患者或慢性心功能不全者，应适当减量。目前尚无特效药物或根治药物，一般采取对症处理。桥本氏甲状腺炎的外科治疗较少，如压迫症状较重，或用甲状腺激素代用后，甲状腺仍有明显增大的患者，可考虑手术治疗。
桥本氏甲状腺炎症通常可以通过使用药物进行治疗。
桥本氏甲状腺炎属于自身免疫疾病，桥本氏甲状腺炎通常会导致甲状腺肿大，同时还会伴随甲状腺功能亢进的情况，后期还会出现甲状腺功能减退等情况。患有桥本甲状腺炎的病人，如果出现了甲状腺功能低下，可以选择使用甲状腺素制剂。对于有甲状腺功能亢进现象的病人，可以使用抗甲状腺的药物。
可以药物治疗，小剂量的药物对身体的副作用很小，只要找到合适的剂量定期复查甲状腺功能即可。也可以动态观察，半年到一年进行复查，根据甲状腺功能检查结果进一步制定治疗方案。
治疗方法如下：
一、药物治疗：1、左甲状腺激素片：患者甲状腺肿大明显，伴压迫症状，且伴甲状腺功能减退，给予左甲状腺激素片治疗，缩小甲状腺，补充甲状腺激素不足；2、受体阻滞剂：如有甲状腺功能亢进症状，可给予受体阻滞剂，必要时可给予少量抗甲状腺药物，但需密切观察甲状腺功能变化，警惕甲状腺功能减退的发生。
二、手术治疗：患者出现结节性甲状腺肿大，疑似恶性病变，有明显压迫症状，或给予甲状腺激素无明显疗效，立即行甲状腺穿刺活检或考虑手术治疗，术后长期给予甲状腺激素。
桥本氏甲状腺炎可以通过细针穿刺细胞学检查。
桥本甲状腺炎者，实际上，诊断要靠细针穿刺进行细胞学检查，但因细针穿刺细胞学检查为有创见，病人经过检查，可和给病人经济方面带来负担，又会给病人带来生理上的伤害。因此，很多人都会选择不用这种方式来检查。因此现在还不是很普遍，对桥本甲状腺炎病人，确诊时，可依赖血中检出甲状腺相关抗体增加，甲状腺相关抗体异常等，通常为桥本甲状腺炎确诊之主要依据。
桥本甲状腺炎的病人通常不会有头痛的症状，这是由于桥本甲状腺炎会有两侧的甲状腺扩散性的肿胀，其坚硬程度可以限制在一方的甲状腺，其主要是由于甲状腺激素在短期内向血液中的分泌。
甲减一旦在体内大量的排出，就会导致甲减，这种情况与甲亢的情况类似，主要有畏热、多汗、易饿、体重下降、性情急躁等，但随着时间的推移，会有可能会产生畏寒、没有精力等问题。