亚急性甲状腺炎等，一般数周或数月后减轻，病程6-12个月，反复发作者甚为罕见。
一旦出现了慢性化过程，则会对患者带来很大的危害，严重时还可导致死亡。如亚急性甲状腺炎反复发作，有可能是糖皮质激素减量过快，停药过早，此症若症状较轻微，可应用非甾体类消炎止疼药，疼痛症状好转即可，如仍伴发热，血沉升高十分明显，可再应用糖皮质激素，以改善症状。对于亚急性甲状腺结节或囊肿者，一般不建议进行治疗。待血沉恢复正常后，再逐步减量，总疗程必须超过6-8周，如停药太快，太早，极易又导致亚急性甲状腺炎的复发。因此对于已经发生了亚急性甲状腺炎的患者，应该尽早进行治疗和护理，避免造成不必要的损失。亚急性甲状腺炎为病毒感染变态反应性炎症，发病前，许多病人都有上呼吸道感染病史。
治疗亚急性甲状腺炎主要通过药物治疗，治疗发热、颈部疼痛等症状。体温高于38.5℃时可进行退热处理，如颈部疼痛、耳颞部疼痛等，可加用非甾体类抗炎药进行止痛治疗，但如果单纯使用非甾体类抗炎药无法控制病情时，排除激素使用的禁忌症，可适当加用激素药物的治疗，具体用药需要在医生的指导下进行，不可盲目用药，容易引发不良反应。
亚急性甲状腺炎好了会复发的。
亚急性甲状腺炎痊愈后，1.6%的病人可复发，年复发率为2.3%。因此，预防复发就显得尤为重要。研究表明复发者比初次发作更轻微，疗程更短暂。如果反复发作的情况下会加重甲状腺结节、钙化等病变。通常单侧患有甲状腺炎后，另侧可复发，亚急性甲状腺炎为可自愈性疾病，建议积极的展开治疗。
亚急性甲状腺炎的反复发作要根据病情轻重来决定。
病人的亚急性甲状腺炎虽然被治好了，但过了一段时间就会复发，如果病人有亚急性甲状腺炎的病因，比如病人有过病理性的前驱症状，比如工作压力过大，工作压力过大等，都有很大的几率会复发。
患有亚急性甲状腺炎后，当出现了单纯依靠口服止痛药无法根治的颈痛等症状时，可以采用激素来进行调理。而激素疗法，在缓解了痛楚的情况下，在减少了激素的用量后，会出现反复发作的情况，需要将激素的用量增加到原来的用量，然后再进行观察。
亚急性甲状腺炎易反复发作。
它是由于病毒或病毒所引起变态反应而引起甲状腺炎症。此病一般都发生于青少年时期，女性比男性更易罹患。病前必有病毒感染史如感冒，发热等。发病时患者出现心悸气短、烦躁易怒等症状，并且还伴有全身乏力、食欲不振等现象，如果不进行有效处理时就可能发展为慢性化脓型甲腺炎，需要积极的进行疾病的控制。
亚急性甲状腺炎在极少数的情况下会出现反复发作，不过几率很小。
大多数亚急性甲状腺炎都会痊愈，只有极少数的亚急性甲状腺炎会出现复发。对于亚急性甲状腺炎的复发，可以通过口服非甾体类的消炎止痛药物或者是激素进行治疗。亚甲炎是一种由病毒引起的疾病，其病程有限，预后良好，一般不会出现甲状腺功能减退症，主要表现为颈前区的疼痛。