脑膜炎双球菌主要致病物质是胶囊，菌毛和内毒素。脑膜炎球菌通常存在于正常人的鼻咽腔中。表现为血管内皮损害，血管壁有炎症坏死和血栓形成，同时有血管周围出血，并有皮肤皮下黏膜及浆膜等局灶性出血。
脑膜炎双球菌，是流行性脑脊髓膜炎的病原菌，革兰染色阴性，需氧，有13个血清型，对理化因素抵抗差，对干燥，热，消毒剂敏感。主要引起流行性脑脊髓膜炎，5岁以下儿童多见，表现为发热，恶心和出血性皮疹等，严重者有剧烈头痛呕吐和颈强直，暴发性病情凶险，1-2天内出现暴发性紫癜，休克，DIC以及严重的中枢神经系统症状。对青霉素，磺胺药敏感，且其容易通过血脑屏障。针对脑膜炎双球菌的疫苗可以有效防止流脑。
脑膜炎球菌特点形态呈肾形成双排列，凹面相对。脑膜炎球菌抵抗力弱，对寒冷、日光、热力、干燥、紫外线及一般消毒剂均敏感。脑膜炎球菌经飞沫传染，也可通过接触病人呼吸道分泌物污染的物品而感染。潜伏期约1~4天。本病的发生和机体免疫力有密切的关系，当机体抵抗力低下时易感。
脑膜炎双球菌疫苗就是流脑疫苗，并不是乙脑疫苗，不能混为一谈，其实乙脑也就是们所俗称的流行性乙型脑炎。注射流脑疫苗是为了预防流行性脑脊髓膜炎。所以脑膜炎双球菌是流脑。
脑膜炎的病人，一经确诊，应该立即住院，可以做隔离，对于脑膜炎的病人，选择有针对性的抗生素，另外在脑膜炎爆发的季节，尽量减少外出的机会，尤其是去一些公众场合，人多聚集的地方。另外，在流行性脑膜炎爆发的季节，出现发热，头痛，精神状态差，应该及时去当地医院就诊。
脑膜炎球菌性脑膜炎是由脑膜炎双球菌（Nm）引起的化脓性脑膜炎。致病菌由鼻咽部侵入血循环，最后局限于脑膜和脊髓膜，形成化脓性脑脊髓膜病变。主要临床表现为突起发热、头痛、呕吐、皮肤有淤斑、淤点及颈项强直等脑膜刺激征。脑脊液呈化脓性改变。此外，脑膜炎球菌可不侵袭脑膜而仅表现为败血症，其中重者可呈暴发型发作，感染亦可发生于上、下呼吸道，关节，心包及眼等部位。