临床表现可涉及全身多个系统，如心血管系统、呼吸系统、消化系统、内分泌系统、代谢系统、泌尿生殖系统等，自觉症状繁多。如出现胸闷、憋气、心慌、濒死感等心脏神经症；胃痛、胃胀、呕吐、腹泻等胃肠神经症。
植物神经功能紊乱的患者会出现许多症状，如头晕、出汗、潮红、失眠、头痛、乏力、心悸、恶心、腹部不适、焦虑、抑郁、胸闷、呼吸困难、食欲不振、性格改变、腹胀、便秘、腹泻、腹痛、四肢麻木、关节痛、全身不适等。但经过各种详细检查，如果没有发现器质性疾病，就会认为是植物神经功能紊乱。
患者需要到神经内科就诊，进行焦虑抑郁量表检查，并根据结果调整药物治疗。
有的人会出现胸闷、憋气的感觉；有的人会有心慌，甚至是濒死感的神经、心脏神经症；有的人会出现胃痛、胃胀、呕吐、腹泻等胃肠神经症，尤其是紧张的时候，腹痛会特别明显；有的患者会表现为头痛、头晕、视物模糊、失眠、健忘、皮肤发麻、皮肤发痒或者会出现周身觉得僵硬、发紧不舒服、四肢麻木、手脚心发热，或者是周身皮肤发热，但是量体温都正常，或者会有潮热出汗，或者会有全身游走性疼痛，游走性异常感觉。
早期植物神经功能紊乱的病人会出现很多的症状，比如头晕，头痛，乏力，出虚汗，面色潮红，失眠，焦虑，抑郁，性格改变，人格改变，心悸，胸闷，呼吸费力，食欲减退，恶心，腹部不适，腹胀，便秘，腹泻，腹痛，肢体麻木，关节疼痛，周身不适等。
一般情况下，胃肠神经功能紊乱的症状可以出现各种各样的消化道的症状，但是相关检查没有异常。具体内容如下：
植物神经紊乱患者常以自觉症状为主，虽然做过多次检查，但结果往往都比较正常。如没有食欲，进食无味，腹胀，恶心，打嗝，烧心，胸闷气短，喜长叹气，喉部梗噎，咽喉不利等症状都属于胃肠神经功能紊乱。建议患者在医生的指导下使用谷维素，维生素B1，解郁抗虑胶囊等药物进行治疗。
胃肠神经功能紊乱的症状可以出现各种各样的消化道的症状，但是相关检查没有异常，比如出现腹痛、腹胀、腹泻、便秘，也可以出现反酸、烧心、恶心、呕吐等，但是完善胃镜、肠镜、CT等检查均没有异常。