喝酒引起头疼的原因，与酒精摄入过量，刺激脑神经，酒精扩张头部血管，还与酒中杂质过多有关，另外一些人因体质原因，酒后比较容易会出现明显的不适，比如头晕、头痛，常常是由于血管扩张引起的。
可能有原发性头痛，或叫做良性头痛，比如有偏头痛或丛集性头痛的病人，喝了之后，可以诱发原发性头痛的发作。另外酒精能扩张血管，使得脑子软脑膜或硬脑膜的血管扩张，包括头皮下的血管也会扩张。血管扩张的时候引起头痛。
喝酒后头疼，如果是经常性的喝酒后头疼就需要戒酒了，可能是由于大脑内部受刺激或者过敏导致的头疼。如果避免不了，在喝酒时多吃点酸性食物，有助于分解酒精。在酒后喝点蜂蜜水，对酒精也有分解作用，缓解头疼。
人饮酒后头疼是因为饮酒后酒精会迅速通过食管、胃到十二指肠，然后在肝脏中进行转化，肝脏中的乙醇脱氢酶会尽快将酒精中的乙醇分解成乙醛，因此会出现脸红、头晕、头痛等症状。
酪胺的物质刺激交感神经末梢释放去甲肾上腺素，而去甲肾上腺素具有收缩血管，升高血压的作用，从而引起头痛。此外喝酒还会降低脑血流量，而脑血流量降低会引起脑内的乳酸，氧离子，钾离子，前列腺素等物质的堆积而引起头痛，还有的人对酒精过敏也会引起头疼。