一般需要综合对症治疗和支持治疗来处理。目前尚未发现特效的可以治疗进行性肌营养不良的药物，只能通过对患者的临床表现进行对症的用药来缓解病情，辅助相应支持治疗，如推拿、按摩等手段，最大限度的控制病情进展，提高患者的生活质量。
一般需多吃些口味清淡的食物。口味清淡的食物比较容易消化，有利于稳定机体新陈代谢的平衡。适当的多吃一些，通常能够增强患者的体质，对进行性肌营养不良病情的恢复比较有帮助。
中医认为与人的肝、脾、肾密切相联，而肌营养不良症又属痿证范畴，故治疗上均应从调理肝、脾、肾入手，还应该给予活血化瘀止痛类药物治疗，并给予针灸推拿以活血化瘀通络。
自己在饮食方面也要加强，也要注意平时以高蛋白富含维生素、钙、锌等营养物质，可以少食多餐，忌食过辣、过咸、不宜食用不宜消化的或者有刺激性的食物，要注意保持良好的心态，避免过度劳累。
药物治疗。可以采用抗胆碱酯酶药物，皮质类固醇进行的药物治疗或利用血浆置换法去除患者血浆中的特异性血浆因子以及乙酰胆碱抗体，如果病情严重，则以选择胸腺切除术为最佳。
肌电图。松弛时可出现自发电位，轻收缩时运动单位电位的平均时限缩短，平均波。骨骼肌CT或MRI检查，通过多部位骨骼肌的CT或MRI影像检查可了解骨骼肌损害的分布范围和严重程度，有助于早期诊断和提供肌肉活检的优选部位。