脑磁共振能看到更多的信息。一些CT显示不出的异常，但在磁共振上则能显示清楚，例如，局灶性脑皮质发育不良。检查费用高和普及程度低，是磁共振检查的缺点。脑梗塞严重与否要结合症状核磁共振检查看脑梗塞的n部位面积等结合评估，尽快去正规医院就诊明确性质。
脑梗死磁共振的表现有：1.脑梗死，根据发病时间可分为不同的几个阶段。六小时之内称为超急性期，6-72小时之内称为急性期，3天到1个月为亚急性期，1个月以上指的是慢性期。2.超急性期或急性期时，T1信号稍低，T2信号稍高。亚急性期是T1信号低，T2信号高。慢性期，通常是T1信号和T2信号都会显著延长。
脑梗死的病人，发病后24小时内，颅脑CT检查可以无明显的病灶。24小时后，颅脑CT检查可出现低密度病灶。大面积脑梗死，一部分病人24小时内可以出现脑水肿征象，比如脑沟变浅或消失。发病6小时内颅脑CT可以发现一些轻微改变，比如大脑中动脉高密度征，皮质边缘及豆状核区灰白质分界不清等。病人发病两周左右，颅脑CT检查病灶可出现等密度，临床上称为模糊效应。
脑梗死磁共振检查是较先进的检查，成像更清楚，与CT相较而言，脑磁共振能看到更多的信息。一些CT显示不出的异常，但在磁共振上则能显示清楚，例如，局灶性脑皮质发育不良。检查费用高和普及程度低，是磁共振检查的缺点。脑梗塞严重与否要结合核磁共振检查看脑梗塞的n部位面积等结合评估。
有很多颅脑疾病在CT上表现不明显，但是磁共振能清楚显示的，例如：新鲜的脑梗死灶在24—48小时内有可能CT是发现不了的，因为只发生了某些化学反应的改变，但是形态学暂时还看不出来，所以CT是发现不了的，但是由于磁共振与CT的成像原理不一样，一般脑梗死6个小时之后，磁共振平扫就能在图像上表现出来。
