需根据患者的病情进行针对的治疗。患者如是因为自身免疫性引起的脑炎，可以通过激素治疗、免疫球蛋白治疗，免疫调节治疗等。如果是病毒感染导致，需要进行抗病毒治疗。
免疫疗法：高效价免疫丙种球蛋白每日肌注，至体温降至38℃以下停用。药物治疗：疗程视病情而定，早期应用，可防止病毒穿入细胞，使人体细胞产生抗病毒蛋白，抑制病毒在体内复制。
一般通过抗炎、减轻脑水肿、控制高热进行治疗。脑炎需要积极治疗，病情较轻的一般治疗效果很好，不太容易留下后遗症，但如果是重症的患者会留下较严重的后遗症或者死亡。
一般来说，小儿病毒性脑炎初期可通过药物治疗、日常调理的方式进行处理，具体分析如下：
感染肠道病毒可能会导致出现小儿病毒性脑炎，小儿病毒性脑炎如果不及时治疗很容易造成不良后果，家长要尽早带宝宝前往医院，在医生的指导下，进行抗炎抗病毒、对症和对有效脏器的功能支持治疗以及高压氧治疗。
在日常生活中，家长要让宝宝多休息，保持营养摄入均衡，适当进行体育锻炼，定期进行常规体检，有助于健康成长。
药物治疗：疗程视病情而定，早期应用，可防止病毒穿入细胞，使人体细胞产生抗病毒蛋白，抑制病毒在体内复制。免疫疗法：高效价免疫丙种球蛋白每日肌注，至体温降至38℃以下停用。
