颈椎消融主要的危害有在手术的过程中器械容易碰到颈髓，会产生神经损伤的症状，比如肢体的麻木，甚至于瘫痪都有可能。另外就是颈椎消融，并不是将间盘摘除，所以日后如果劳力或是接触潮湿寒冷的环境，也有复发的可能性。
有可能会出现颈椎病复发的情况，也有可能会产生穿刺部位的疼痛，在进行了颈椎射频消融术后，有可能由于一些神经的刺激，会在颈部、肩部或者是上肢的一些其他部位产生麻木、发凉等异常的感觉。
射频消融手术之后主要是治疗一些心律失常，特别是房颤时性心动过速，预激综合征等。有可能会导致局部的不舒服，主要与手术有创伤性有一定的关系，需要检查心电图和心脏彩超，了解有没有心脏的病变，这是最主要的。
肝癌射频消融术后遗症首先就是肝部位好的细胞也会被一并烧死，其次对肝周边部位的细胞也会造成损伤，最后就是射频消融不彻底造成复发。以及穿刺部位疼痛，常见于术后72小时内。
心脏射频消融术的后遗症有，血管穿刺的并发症，包括局部出血、血肿形成、穿刺部位的感染、气胸、血栓形成、栓塞等。管操作的并发症，包括主动脉瓣返流、心肌穿孔、心包填塞等。放电消融的并发症，包括房室传导阻滞、心肌梗死等。进行心脏射频消融术以后，还是有一定的复发可能。