心房颤动最常见的并发症通常是栓塞。
心房颤动最常见的并发症就是栓塞，尤其是脑动脉栓塞。心房颤动的发病率在2%-6%之间，而房颤的病人有75%概率出现脑动脉栓塞。此外，在心房颤动的影响下，病人也可能出现周围动脉栓塞的情况，80%周围动脉栓塞患者会有心房颤动，因为房颤病人的心脏附壁上的血栓脱落，血液会随着血管内的血液流向周围的血管而发生栓塞。因此，出现心房颤动后要及时治疗，以免发生并发症。病人平时要多休息，要保持心情稳定，不要过度劳累。
如果有心房颤动，可能是因为心律失常所致，要进行全面的检查，24小时动态心电图确诊，然后进行药物治疗，这样可以有效地治疗和恢复，并且要有充足的休息时间。风湿性的心脏病、肺心病、高血压性心脏病、冠心病、扩心病等疾病也可能会导致心房颤动，建议心房颤动的患者及时前往正规医院，查明自己心房颤动的具体原因，然后进行必要的治疗。
持续性房颤的治疗涉及到其病因的治疗。与甲状腺功能亢进一样，甲状腺功能亢进可引起持续性房颤，因此治疗甲状腺功能亢进有助于持续性房颤的治疗。控制心室率，重建窦性心率，预防栓塞。由于地高辛能增加房室传导的延迟和阻滞，故通常可通过地高辛控制心室率。例如，独自地高辛不够有效。维拉帕米(维必定)最有效。
心房颤动的临床表现，与其发作的类型心室率快慢，心脏结构和功能状态，以及是否形成心房附壁血栓有关。心室率快者心悸胸闷等症状明显并存器质性心脏病者可诱发或加重心功能不全，甚至诱发急性肺水肿心室率不快者症状常较轻微，可有心悸，胸闷，运动量运动耐量下降并存，器质性心脏病者可诱发或加重心功能不全。房颤易形成左房负壁血栓，血栓栓塞，尤其是脑栓塞是重要致残和致死的原因。
48小时内心房颤动可以直接复率，否则需要前三后四周的抗凝治疗，房颤治疗主要是控制心室率，复率，预防并发症三种，房颤发病和高血压，冠心病，瓣膜病，甲亢有关系。可以到心内科诊治，注意休息劳逸结合，避免焦虑，戒烟酒，避免刺激性食物。