原因一般可分为两种：生殖感染手淫或夫妻生活过程中，由于卫生条件不足，导致细菌侵入，引发龟头感染炎症，并发生龟头水肿。妻生活频繁短时间内过度手淫或是夫妻生活频率过快、行为比较粗鲁，对龟头的刺激过大。
最常见的原因是感染、过敏、物理等因素造成包皮水肿，不注意外生殖器卫生也可能出现包皮红肿，如果不注意经常清洗外生殖器，或清洗时没有将包皮上翻，包皮皮脂腺的分泌物就会积存在包皮下，形成像豆腐渣样的包皮垢。
怀孕期间很多孕妇会出现水肿，如果是生理性的水肿则不必过于担心,如果是病理性性的水肿则需要积极治疗。
在怀孕期间中晚期，孕妇出现脚腕以下水肿，这是正常的生理性的表现。由于孕期子宫增大压迫下腔静脉回流，造成脚部引起轻度水肿，孕妇可以通过休息就能够缓解。
如果在怀孕中晚期出现脚部或者眼睑部的水肿，则可能是因为妊娠期高血压疾病、妊娠期肾脏疾病或者是风湿免疫系统疾病导致的。这些疾病都有一个共同的特点，那就是可以损伤肾脏，造成蛋白质从尿液当中漏出，引起低蛋白血症，进而引起水肿。孕妇需要及时治疗，对症下药。
不注意卫生，不清洗外生殖器，或在清洗的时候没有把包皮上翻，包皮皮脂腺的分泌物就会积存在包皮下，包皮垢培养细菌引起水肿。手淫或夫妻生活频繁，行为比较粗鲁，对龟头的刺激过大，导致细菌侵入，引发龟头感染炎症，并发龟头水肿。
患龟头水肿的情况大部分是由于没有注意个人卫生，包皮过长没有及时清理所导致的，比如包皮龟头炎，就会出现龟头水肿的情况，可以在医生的指导下口服或者是注射抗生素进行治疗，也可以通过局部涂抹抗生素软膏来消除局部炎症，这样可以缓解龟头水肿的症状。