药物疗法，配合抗生素选用能“清除内外毒素的尿路感染药物”一同使用，起到抗炎的效果，才能有更好的治疗效果。局部应用治疗，经尿道插管，注入抗真菌类等的一些的药物，进行冲洗，可有效治疗。
消除易感因素，这是预防和治疗真菌性尿感的最好方法，免疫抑制药、解除尿路梗阻，尽量减少导尿及长期保留尿管等。中医治疗，中医常采用清热利湿并重的原则，特别是对于湿热下注型患者疗效更为明显。
艾灸治疗，适用于湿热下注者，可选取肾俞、膀胱俞、命门、三阴交、阴陵泉等穴，用泻法。辅助治疗，急性期应多饮水，以增加尿量，对尿道有冲洗作用。有尿频、尿急及尿痛时，可服用解痉药物。
静脉滴注药液应避光缓慢地滴入，耐受性差者可酌减剂量;临床疗效差者可酌加剂量。消除易感因素，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。
碱化尿液治疗，可以给患者服用些感化尿液类的药物，可以碱化尿液，抑制真菌生长的环境；局部应用治疗，经尿道插管，注入抗真菌类等的一些的药物，进行冲洗，可有效治疗。
消除易感因素疗法，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。药物疗法，可以用一些抗真菌类的药物，也可以局部冲洗，症状明显严重可考虑输液治疗，都具有比较好的效果。