发现慢性肾盂肾炎的治疗办法有：病因治疗，首先应找寻不利因素，如尿路结石、畸形、尿道颈梗阻、前列腺炎、尿道内炎症病灶、膀胱输尿管返流等，并设法纠正。一般治疗，去除发病因素，尤其是解除尿流不畅、尿路梗阻，纠正肾和尿路畸形，这样才能彻底有效治疗而不再发。
治疗慢性肾盂肾炎的办法是：抑菌疗法，选择有效的抗菌药，以抑制尿中细菌大量繁殖，控制尿感发作，能有效治疗慢性肾盂肾炎。一般治疗，去除发病因素，尤其是解除尿流不畅、尿路梗阻，纠正肾和尿路畸形，这样才能彻底有效治疗而不再发。
慢性肾盂肾炎较好的治疗方法是：中药治疗，可服用中药，增强体质及抗感染能力，减少复发，保护肾功能，必要时可采取中西医结合，取长补短。抗菌药物治疗，常需两类药物联合应用，药效无用时可选用敏感药物分2-4组，轮换应用，可防止再发，对重新感染引起再发的慢性肾盂肾炎更为有效。
治疗慢性肾盂肾炎的方法有：一般治疗，去除发病因素，尤其是解除尿流不畅、尿路梗阻，纠正肾和尿路畸形，这样才能彻底有效治疗而不再发。紫外线疗法，对于反复发作的慢性肾盂肾炎无肾功能不全的病人，采用肾区紫外线照射，有一定的治疗作用。
慢性的肾盂肾炎，会导致肾盂肾盏的扩张而变形，从而会对患者的肾功能产生影响，会导致肾功能不全。但是总体上慢性肾盂肾炎的患者，肾脏的损害进展相对较慢，十几年或者几十年可能都不会进展到严重的终末肾脏病，因此存活时间也是较长的。
出现慢性肾盂肾炎后的治疗办法有：病因治疗，先查明原因，再根据病因预防及治疗，若病情较轻，可按药敏选择用药，若病情较重，应用大剂量杀菌药治疗。紫外线疗法，对于反复发作的慢性肾盂肾炎无肾功能不全的病人，采用肾区紫外线照射，有一定的治疗作用。