不管中药还是西药肾囊肿靠药物是无法治疗的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。如果囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过10cm则可能需要手术治疗。
肾囊肿的药物治疗，目前来说没有什么特效药针对肾囊肿让囊肿不长或者是消失。主要还是因为肾囊肿它主要是肾小管憩室形成的，跟年龄相关，可能是属于退行性的改变。而且肾囊肿它对身体没有什么太大的影响，即使是肾脏中有几个，两个、三个，甚至是五个、十个的小囊肿，它对肾功能以及生活都不会造成任何影响。
艾灸是不能治疗肾囊肿的，药物也不能治疗肾囊肿，肾囊肿的发病的原因是扩张的肾小管，这段扩张的肾小管，逐步独立，就形成一个囊肿，肾小管的壁有分泌功能，分泌液多就会囊肿增大，分泌液少囊肿增大的不明显。
胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
肾囊肿可单发或者多发，常见于男性，可压迫血管或者引发尿路梗阻出现病症，可有腰腹背部间歇性钝痛，继发感染可出现尿频尿急等症，B超，ct检查可诊断，手术治疗是有效办法。就诊肾脏外科检查治疗，适当补充高纤维、高维素食物，多吃新鲜蔬果，忌饮酒，少吃辛辣、油炸食品。
肾囊肿可以分为单纯性肾囊肿和多囊肾。单纯性肾囊肿大多没有症状，一般在健康查体时偶然发现，单纯肾囊肿一般不需要特殊处理。除非是体积比较大，超过四公分，出现了压迫症状，或者是出血感染。但也没有口服药物治疗，一般要超声引导下注入硬化剂或者是腹腔镜微创手术去顶治疗或者是开放手术切除。